[发明专利]实时电子测序

摘要

描述了实时电子测序方法、装置和系统。使用包含具有一个或两个电极的电容装置的纳米电子元件的阵列或纳米FET装置的阵列来提供聚合酶‑模板复合物中模板核酸的序列信息，所述聚合酶‑模板复合物结合至纳米级电子元件附近或结合至纳米级电子元件附近的基材。在聚合酶介导的核酸合成的条件下将包含具有阻抗标记物、电容标记物或电导标记物的核苷酸类似物的测序反应混合物导入包含电容装置或纳米FET的纳米级电子元件的阵列。使用测量的阻抗、电导或电容通过鉴定掺入生长链的核苷酸类似物的标记物的类型来确定核苷酸类似物掺入的时间顺序。

主权项

一种用于核酸测序的方法，所述方法包括：提供包含能够测量阻抗的纳米级电子元件的阵列的基材，多个纳米级元件包含接合或靠近所述纳米级电子元件的单个聚合酶复合物，所述聚合酶复合物包含聚合酶和模板核酸；使所述基材接触多种类型的核苷酸类似物，各类型包含与所述核苷酸类似物的磷酸部分接合的不同的阻抗标记物，接触条件为发生聚合酶介导的核酸合成，导致掺入所述核苷酸类似物和切割相应的阻抗标记物，并导致新生核酸链的生长；测量所述多个纳米级电子元件中每一个处的阻抗，当核苷酸类似物位于所述酶的活性位点中时，所述核苷酸类似物上的阻抗标记物生成所述纳米级电子元件处可测量的阻抗变化；随时间监测所述多个纳米级元件处的阻抗，所述阻抗的变化表示某一类型的核苷酸类似物的掺入事件；以及使用随时间测量的阻抗鉴定掺入的核苷酸类似物的类型以确定模板核酸的序列。