[发明专利]通过单核苷酸多态性标记预测田间褐飞虱繁殖力的方法有效
申请号: | 201310586677.3 | 申请日: | 2013-11-20 |
公开(公告)号: | CN103602741A | 公开(公告)日: | 2014-02-26 |
发明(设计)人: | 张文庆;孙仲享;翟一凡;张鉴清;康奎;邱洁琪;沈嘉炜 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 | 代理人: | 刘婉 |
地址: | 510275 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提供了一种通过单核苷酸多态性标记预测田间褐飞虱繁殖力的方法,其步骤如下:(1)采集褐飞虱雌虫,抽提单头基因组DNA;(2)以上述DNA为模板,用引物分别扩增含ACE-862、VGR-816和VG3087三个SNP的片段;(3)将PCR产物进行测序,获得每只雌虫的三个SNP的基因型;(4)将上述获得的SNP信息代入预测模型,算出单头褐飞虱的繁殖力。利用本发明的方法,能够快速准确预测褐飞虱种群的繁殖力,节省人力物力,缩短实验周期。 | ||
搜索关键词: | 通过 核苷酸 多态性 标记 预测 田间 褐飞虱 繁殖力 方法 | ||
【主权项】:
一种通过单核苷酸多态性标记预测田间褐飞虱繁殖力的方法,其步骤如下:(1)采集褐飞虱雌虫,抽提单头基因组DNA;(2)以上述DNA为模板,用引物分别扩增含ACE‑862、VGR‑816和VG3087三个SNP的片段;(3)将PCR产物进行测序,获得每只雌虫的三个SNP的基因型;(4)将上述获得的SNP信息代入以下预测模型,算出单头褐飞虱的繁殖力,全部虫子的平均繁殖力即为该种群的繁殖力:Y=212.735‑93.585*ACE‑862+36.087*VGR‑816+48.276*VG3087其中,因变量Y是单头褐飞虱繁殖力,自变量ACE‑862、VGR‑816和VG3087分别是位于ACE、VgR和Vg基因上的SNP的加性、显性或隐性效应的赋值;ACE‑862的三种基因型CC、CA和AA分别取值0、0、1;VgR‑816的三种基因型AA、AG和GG分别取值0、1、2;VgR3087的两种基因型GG和GA分别取值0、1。
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