[发明专利]一种快速鉴定稻米“南粳46” 品种真伪和纯度的分子标记方法

摘要

本发明涉及一种快速鉴定稻米“南粳46”品种真伪和纯度的分子标记方法，属农业生物工程技术领域。首先从不同水稻品种的单粒稻米胚乳中提取基因组DNA；然后利用低直链淀粉含量基因Wx-mq的特异分子标记JS-Wx-mq进行扩增，筛选同时具有439bp和292bp特征条带Wx-mq基因纯合的低直链淀粉含量稻米品种；在此基础上，继续利用5个微卫星标记对具有特征条带的低直链淀粉含量稻米品种DNA进行PCR扩增，如果在上述5个微卫星标记位点分别再具有特征条带，则证实该稻米品种为“南粳46”。利用本发明方法可以实现对优良食味稻米“南粳46”品种真伪和纯度的快速鉴定，从而保证“南粳46”的稻米品质，有利于其品种品牌维护和产业化开发。

主权项

一种快速鉴定稻米“南粳46”品种真伪和纯度的分子标记方法，其特征在于：（1）提取单粒稻米胚乳基因组DNA； （2）以上述基因组DNA为模板，用低直链淀粉含量基因Wx‑mq的特异标记JS‑Wx‑mq正向外引物序列：5'‑ATGTTGTGTTCTTGTGTTCTTTGCAGGC‑3'反向外引物序列：5'‑GTAGATCTTCTCACCGGTCTTTCCCCAA‑3'正向内引物序列：5'‑GGGTGAGGTTTTTCCATTGCTACAATCG‑3'反向内引物序列：5'‑GTCGATGAACACACGGTCGACTCAAT‑3'进行PCR扩增，筛选同时具有439 bp和292 bp两条特征条带Wx‑mq基因纯合的低直链淀粉含量稻米品种；（3）在此基础上，利用微卫星标记JS‑RM206、JS‑RM495、JS‑RM505、JS‑RM223和JS‑RM1358：   标记JS‑RM206正向引物序列：5'‑CCCATGCGTTTAACTATTCT‑3'反向引物序列：5'‑CGTTCCATCGATCCGTATGG‑3'标记JS‑RM495正向引物序列：5'‑AATCCAAGGTGCAGAGATGG‑3'反向引物序列：5'‑CAACGATGACGAACACAACC‑3'标记JS‑RM505正向引物序列：5'‑AGAGTTATGAGCCGGGTGTG‑3'反向引物序列：5'‑GATTTGGCGATCTTAGCAGC‑3'   标记JS‑RM223正向引物序列：5'‑GAGTGAGCTTGGGCTGAAAC‑3'反向引物序列：5'‑GAAGGCAAGTCTTGGCACTG‑3'标记JS‑RM1358正向引物序列：5'‑GATCGATGCAGCAGCATATG‑3'反向引物序列：5'‑ACGTGTGGCTGCTTTTGC‑3'继续对上述具有439 bp和292 bp特征条带的低直链淀粉含量稻米品种DNA进行PCR扩增，筛选在JS‑RM206、JS‑RM495、JS‑RM505、JS‑RM223和JS‑RM1358标记位点分别具有173 bp、149 bp、181 bp、151 bp和170 bp特征条带的品种，即为“南粳46”。