[发明专利]一种设计碱基替换或插入缺失的SNP分子标记的方法无效
申请号: | 201310062218.5 | 申请日: | 2013-02-27 |
公开(公告)号: | CN103146823A | 公开(公告)日: | 2013-06-12 |
发明(设计)人: | 李学军;杨子博;李立群;吴青霞;杨林;邵慧;冉从福 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京爱普纳杰专利代理事务所(特殊普通合伙) 11419 | 代理人: | 何自刚 |
地址: | 712100 陕西省西安*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | 本发明公开了一种设计碱基替换或插入缺失的SNP分子标记的方法,该方法针对由于平常所用的TaqDNA聚合酶要进行正常扩增,其5′可以不需要与模板完全匹配,而其3′要求完全配对。针对这个特性,可以特异地将所发现的SNP位点设计在引物3′位置;针对突变型的基因设计的引物与野生型的基因会形成3′端错配,导致不能正常扩增;同样以野生基因设计的引物与突变型基因的3′端产生错配,也同样在突变型个体基因组中不能正常扩增。本发明通过两次PCR,再通过特定技术检测PCR结果,可以方便地确定该个体SNP位点的基因型。 | ||
搜索关键词: | 一种 设计 碱基 替换 插入 缺失 snp 分子 标记 方法 | ||
【主权项】:
一种设计碱基替换或插入缺失的SNP分子标记的方法,其特征在于,该方法以已知功能基因SNP突变位点为参照,将此位点设计在特异引物的3′位置;通过分别设计Allele1和Allele2特异位点两对引物,通过两次PCR,再通过技术检测PCR结果,确定出个体SNP位点的基因型,通过标记功能验证及稳定性检测,将该分子标记用于辅助选择育种。
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