[发明专利]一种构建鸡肌肉肌苷酸合成途径相关关键酶基因网络调控方法有效
| 申请号： | 201210497419.3 | 申请日： | 2012-11-29 |
| 公开（公告）号： | CN103150487A | 公开（公告）日： | 2013-06-12 |
| 发明（设计）人： | 陈国宏;常国斌;栾德琴;陈蓉;张颖;马腾;夏明秀;戴爱琴;翟飞;刘璐;陈静;王洪志;徐璐 | 申请（专利权）人： | 扬州大学 |
| 主分类号： | G06F19/12 | 分类号： | G06F19/12 |
| 代理公司： | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人： | 卢亚丽 |
| 地址： | 225009 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明属于动物育种学、发育生物学和细胞生物学领域。涉及一种利用表达谱数据及相关生物信息工具分析和构建网络调控的方法。该方法首先是建立肌苷酸相关基因的数据集，计算各基因的权重模型，初步选择基因表达调控，其次是求相关系数并求解，构建网络图，最后是结合建立的整数非线性规划模型，并基于KEGG数据库构建肌苷酸相关基因的网络调控图。本发明本研究以我国地方鸡种如皋黄鸡为素材，构建IMP合成途径中8个关键酶的寡核苷酸探针，在分子杂交的基础上筛选出基于RNA水平上的调控模型，揭示风味物质—IMP合成关键酶在转录水平上的表达差异。为“优质鸡”的培育和产业发展提供理论依据。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 构建 肌肉 肌苷酸 合成 途径 相关 关键 基因 网络 调控 方法 | ||
【主权项】：
一种构建鸡肌肉肌苷酸合成途径相关关键酶基因网络调控方法，其特征是：首先是建立肌苷酸相关基因的数据集，计算各基因的权重模型，初步选择基因表达调控，其次是求相关系数并求解，构建网络图，最后是结合建立的整数非线性规划模型，并基于KEGG数据库构建肌苷酸相关基因的网络调控图。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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