[发明专利]一种检测寡核苷酸与目的基因组的相似性的方法有效
| 申请号： | 201210099724.7 | 申请日： | 2012-04-06 |
| 公开（公告）号： | CN102732609A | 公开（公告）日： | 2012-10-17 |
| 发明（设计）人： | 张岩;孙义民;杨萍;张亮 | 申请（专利权）人： | 博奥生物有限公司;清华大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅 |
| 地址： | 102206 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种检测寡核苷酸与目的基因组的相似性的方法。本发明方法，包括如下步骤：1)以目的基因组DNA为模板，用5′末端连接有待测寡核苷酸的随机引物作为引物，进行DNA合成反应，得到其中一条链的5’末端带有所述寡核苷酸A的双链DNA，记作产物I；2)以所述产物I为模板，以所述待测寡核苷酸为引物，进行PCR扩增反应，若未得到PCR扩增产物，则确认所述寡核苷酸与所述目的基因组无相似性，若得到PCR扩增产物，则确认所述寡核苷酸与所述目的基因组有相似性；所述PCR扩增产物为非引物二聚体。实验表明，本发明所述的方法可以准确、直观地检测tag序列和某种生物基因组的相似性，并且操作简便，成本低，耗费时间少。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 检测 寡核苷酸 目的 基因组 相似性 方法 | ||
【主权项】：
一种辅助检测寡核苷酸与目的基因组或目的转录组的相似性的方法，包括如下步骤：1)以目的基因组DNA或目的转录组RNA为模板，用5′末端连接有寡核苷酸A的随机引物作为引物，进行DNA合成反应，得到5’末端带有所述寡核苷酸A的DNA，记作产物I；2)以所述产物I为模板，以寡核苷酸A为引物，进行PCR扩增反应，记录出现PCR扩增产物时的反应循环数，记作循环数A；所述PCR扩增产物为非引物二聚体；3)用步骤1)和步骤2)相同的方法获得寡核苷酸B对应的循环数，记作循环数B；4)比较循环数A和循环数B的大小，若循环数A大于循环数B，则确认寡核苷酸A与所述目的基因组或所述目的转录组的相似性低于寡核苷酸B与所述目的基因组或所述目的转录组的相似性；若循环数A小于循环数B，则确认寡核苷酸A与所述目的基因组或所述目的转录组的相似性高于寡核苷酸B与所述目的基因组或所述目的转录组的相似性。
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