[发明专利]检测药物防癌效果的非损伤性分子方法无效
| 申请号： | 200810033742.9 | 申请日： | 2008-02-21 |
| 公开（公告）号： | CN101240315A | 公开（公告）日： | 2008-08-13 |
| 发明（设计）人： | 赵立平;魏华;庞小燕;贾伟;吴大正 | 申请（专利权）人： | 上海交通大学 |
| 主分类号： | C12Q1/06 | 分类号： | C12Q1/06;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 上海交达专利事务所 | 代理人： | 王锡麟;王桂忠 |
| 地址： | 200240*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种药物开发领域的检测药物防癌效果的非损伤性分子方法，步骤为：(1)收集粪便样本，并提取粪便微生物基因组总DNA；(2)使用指纹图谱分析技术对各组动物肠道微生物群落结构进行平行比较；(3)对指纹图谱进行主成分分析，偏最小二乘判别分析，寻找与药物防癌有效性相关的重要指纹谱带；(4)对重要指纹谱带所代表的微生物进行鉴定，根据其序列设计针对这些微生物的种特异性引物和探针，进行实时定量PCR，对健康动物、具有癌前病变动物以及药物防癌剂干预动物间的这些重要微生物数量上的差异进行比较。本发明能克服现有判断药物防癌剂方法的不足，为检测对结肠癌的药物防癌效果提供一种非损伤性的分子方法。 | ||
| 搜索关键词： | 检测 药物 效果 损伤 分子 方法 | ||
【主权项】：
1、一种检测结肠癌药物防癌效果的非损伤性分子方法，其特征在于：包括如下步骤：(1)收集粪便样本，并提取粪便微生物基因组总DNA：收集健康动物、具有癌前病变动物以及药物防癌剂干预动物的粪便样本并提取这些粪便样本的微生物基因组总DNA；(2)使用指纹图谱分析技术如16S rDNA V3区PCR-TGGE/DGGE对各组动物肠道微生物群落结构进行平行比较：扩增粪便样本微生物基因组总DNA的16S rDNAV3区，并通过TGGE/DGGE技术分析比较健康动物、具有癌前病变动物以及药物防癌剂干预动物的粪便样本微生物群落结构的差别。(3)对指纹图谱进行主成分分析，偏最小二乘判别分析，寻找与药物防癌有效性相关的重要指纹谱带；(4)对重要指纹谱带所代表的微生物进行鉴定，根据其序列设计针对这些微生物的种特异性引物和探针，进行实时定量PCR，对健康动物、具有癌前病变动物以及药物防癌剂干预动物间的这些重要微生物数量上的差异进行比较，在健康动物与化学防癌有效组动物中无区别，而均与癌前病变动物具有差异的微生物为检测药物防癌效果的指示微生物。
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