[发明专利]太平洋牡蛎EST微卫星标记的筛选方法有效
| 申请号： | 200710027648.8 | 申请日： | 2007-04-23 |
| 公开（公告）号： | CN101058831A | 公开（公告）日： | 2007-10-24 |
| 发明（设计）人： | 喻子牛;王艳红 | 申请（专利权）人： | 中国科学院南海海洋研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 广州科粤专利代理有限责任公司 | 代理人： | 赖汉光 |
| 地址： | 510301广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开一种太平洋牡蛎EST微卫星标记的筛选方法，包括利用GeneBank公布的太平洋牡蛎的ESTs的序列，利用微卫星检索软件SSRhunter进行微卫星位点的查找，对于2－6个碱基重复单元重复次数大于5的微卫星片断进行筛选分离，从而得到含有微卫星重复的ESTs序列；然后在微卫星重复序列两端的侧翼序列设计引物，并进一步检测优化引物成为微卫星标记；最后对微卫星标记的重复性、稳定性和多态性进行综合评价，得到微卫星标记；本发明用于做太平洋牡蛎种质资源和遗传多样性的分析，分子群体遗传学、种质资源鉴定、遗传图谱的构建和功能基因的研究，进一步用于太平洋牡蛎的育种和养殖。 | ||
| 搜索关键词： | 太平洋 牡蛎 est 卫星 标记 筛选 方法 | ||
【主权项】：
1.一种太平洋牡蛎EST微卫星标记的筛选方法，其特征是首先利用GeneBank公布的太平洋牡蛎的ESTs的序列，利用微卫星检索软件SSRhunter进行微卫星位点的查找，对于2-6个碱基重复单元重复次数大于5的微卫星片断进行筛选分离，从而得到含有微卫星重复的ESTs序列；然后在微卫星重复序列两端的侧翼序列设计引物，并进一步检测优化引物成为微卫星标记；最后对微卫星标记的重复性、稳定性和多态性进行综合评价，得到微卫星标记。
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