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[发明专利]同时编辑靶标双链核苷酸序列的两条链的方法和组合物-CN202180049194.2在审
发明人： D.R.刘;A.V.安扎隆;J.M.利维;X.高;C.J.波德拉茨基 -专利权人：布罗德研究所股份有限公司;哈佛大学的校长及成员们
申请日： 2021-05-07 - 公布日： 2023-05-09 - 主分类号： C12N9/12 文献下载
摘要：本公开提供了用于在待编辑的靶位点处同时编辑双链DNA序列的两条链的系统、组合物和方法。在一些方面，系统包括第一和第二引导编辑器复合物，其中第一和第二引导编辑器复合物中的每一个包含：(1)引导编辑器，其包含：(i)核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)，和(ii)具有RNA依赖性DNA聚合酶活性的多肽；和(2)pegRNA，其包含间隔区序列、gRNA核心、DNA合成模板和引物结合位点，其中DNA合成模板编码期望的DNA序列或其互补物，其中期望的DNA序列及其互补物形成包含整合到待编辑的靶位点中的编辑部分的双链体。在一些方面中，系统包括各自包含引导编辑器和PEgRNA的第一、第二、第三和第四引导编辑器复合物。本文还提供了用于在待编辑的靶位点处同时编辑双链DNA的两条链的方法。本文进一步提供了药物组合物、多核苷酸、载体、细胞和试剂盒。
同时编辑靶标核苷酸序列两条链方法组合

[发明专利]编辑核苷酸序列的方法和组合物-CN202080036566.3在审
发明人： D.R.刘;A.V.安扎隆;G.纽比;K.埃弗雷特 -专利权人：布罗德研究所股份有限公司;哈佛大学的校长及成员们
申请日： 2020-03-19 - 公布日： 2022-03-01 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本公开提供了用于对靶DNA分子(如，基因组)进行引导编辑的组合物和方法，所述引导编辑使得能够掺入核苷酸变化和/或靶向诱变。核苷酸变化可包括单核苷酸变化(如，任何转换或任何颠换)、一个或多个核苷酸插入或者一个或多个核苷酸缺失。更具体地，本公开提供了包含核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)和聚合酶(如，逆转录酶)的融合蛋白，其由经修饰的向导RNA(被称为PEgRNA)引导至特定DNA序列。PEgRNA(相对于标准向导RNA)已改变为包含延伸部分，该延伸部分提供编码单链DNA瓣的DNA合成模板序列，其与待编辑的靶向内源性DNA序列的链同源但包含期望的一个或多个核苷酸变化，并且在被聚合酶(如，逆转录酶)合成之后掺入靶DNA分子中。本文还公开了利用引导编辑的各种方法，包括治疗三核苷酸重复缩减疾病、安装靶向肽标签、通过安装保护突变来治疗朊病毒病、操纵RNA编码基因以安装用于控制RNA功能和表达的RNA标签，使用引导编辑构建复杂的基因文库，使用引导编辑将免疫表位插入蛋白，使用引导编辑将可诱导的二聚化结构域插入蛋白靶标，以及递送方法等。
编辑核苷酸序列方法组合

[发明专利]编辑核苷酸序列的方法和组合物-CN202080036738.7在审
发明人： D.R.刘;A.V.安扎隆;P.伦道夫;J.尼尔森 -专利权人：布罗德研究所股份有限公司;哈佛大学的校长及成员们
申请日： 2020-03-19 - 公布日： 2022-01-04 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本公开提供了用于对靶DNA分子(如，基因组)进行引导编辑的组合物和方法，所述引导编辑使得能够掺入核苷酸变化和/或靶向诱变。核苷酸变化可包括单核苷酸变化(如，任何转换或任何颠换)、一个或多个核苷酸插入或者一个或多个核苷酸缺失。更具体地，本公开提供了包含核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)和聚合酶(如，逆转录酶)的融合蛋白，其由经修饰的向导RNA(被称为PEgRNA)引导至特定DNA序列。PEgRNA(相对于标准向导RNA)已改变为包含延伸部分，该延伸部分提供编码单链DNA瓣的DNA合成模板序列，其与待编辑的靶向内源性DNA序列的链同源但包含期望的一个或多个核苷酸变化，并且在被聚合酶(如，逆转录酶)合成之后掺入靶DNA分子中。本文还公开了利用引导编辑的各种方法，包括治疗三核苷酸重复缩减疾病、安装靶向肽标签、通过安装保护突变来治疗朊病毒病、操纵RNA编码基因以安装用于控制RNA功能和表达的RNA标签，使用引导编辑构建复杂的基因文库，使用引导编辑将免疫表位插入蛋白，使用引导编辑将可诱导的二聚化结构域插入蛋白靶标，以及递送方法等。
编辑核苷酸序列方法组合

[发明专利]编辑核苷酸序列的方法和组合物-CN202080036993.1在审
发明人： D.R.刘;A.V.安扎隆 -专利权人：布罗德研究所股份有限公司;哈佛大学的校长及成员们
申请日： 2020-03-19 - 公布日： 2022-01-04 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本公开提供了用于对靶DNA分子(如，基因组)进行引导编辑的组合物和方法，所述引导编辑使得能够掺入核苷酸变化和/或靶向诱变。核苷酸变化可包括单核苷酸变化(如，任何转换或任何颠换)、一个或多个核苷酸插入或者一个或多个核苷酸缺失。更具体地，本公开提供了包含核酸可编程DNA结合蛋白(napDNAbp)和聚合酶(如，逆转录酶)的融合蛋白，其由经修饰的向导RNA(被称为PEgRNA)引导至特定DNA序列。PEgRNA(相对于标准向导RNA)已改变为包含延伸部分，该延伸部分提供编码单链DNA瓣的DNA合成模板序列，其与待编辑的靶向内源性DNA序列的链同源但包含期望的一个或多个核苷酸变化，并且在被聚合酶(如，逆转录酶)合成之后掺入靶DNA分子中。本文还公开了利用引导编辑的各种方法，包括治疗三核苷酸重复缩减疾病、安装靶向肽标签、通过安装保护突变来治疗朊病毒病、操纵RNA编码基因以安装用于控制RNA功能和表达的RNA标签，使用引导编辑构建复杂的基因文库，使用引导编辑将免疫表位插入蛋白，使用引导编辑将可诱导的二聚化结构域插入蛋白靶标，以及递送方法等。
编辑核苷酸序列方法组合

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