本申请涉及一种检测基孔肯雅病毒的多肽、试剂盒和方法,所述多肽可特异性结合CHIKV抗原蛋白;所述多肽的序列包括(1)~(5)中至少一项的序列:(1)SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列;(2)SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列;(3)SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列;(4)SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列;(5)SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:4中的至少一条序列的氨基酸被目标氨基酸替换得到的氨基酸序列,每条序列中氨基酸替换的个数不超过3个。本申请的多肽,可替代传统动物免疫抗体使用,从而能够快速、即时、准确地检测CHIKV及其浓度。