本发明提供了一种膨腹海马性别鉴定SNP位点及性别鉴定方法,所述SNP位点所在的碱基序列为SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3、SEQ ID No.4、SEQ ID No.5。所述膨腹海马性别鉴定方法,包括以下步骤,S1,提取膨腹海马DNA;S2,以提取的DNA为模板,进行PCR,扩增序列SEQ ID No.1‑SEQ ID No.5,序列SEQ ID No.1‑SEQ ID No.5对应的PCR引物依次为SEQ ID No.6‑SEQ ID No.15所示;S3,将PCR产物进行测序验证,并根据所述SNP位点判断海马的雌性;若SNP位点为杂合型,则为雄性,若SNP位点为纯合型,则为雌性。