本发明公开了拉氏鱥微卫星标记组合及引物对组合物及应用,拉氏鱥微卫星标记组合,该组合包括微卫星标记:PL02、PL08、PL09、PL12、PL17、PL19、PL25、PL27、PL36、PL42、PL44、PL60、PL62、PL63、PL65和PL68,所述微卫星标记的核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.16所示。本发明的拉氏鱥卫星标记是从转录组序列中筛选出的微卫星标记,出现无效等位基因的概率小。本发明提供的微卫星标记弥补了拉氏鱥微卫星标记的空白,可为拉氏鱥群体遗传学分析,遗传多样性检测,亲缘关系鉴定,分子标记辅助育种提供有力工具。