本发明涉及薯蓣皂素的生物合成技术领域,具体涉及薯蓣皂素合成相关蛋白、其编码基因及其应用。本发明提供的薯蓣皂素合成相关蛋白具有如SEQ ID NO.1‑3任一所示的氨基酸序列。该蛋白及其编码基因参与薯蓣皂素的合成,为实现薯蓣皂素的生物合成提供了必要的基因资源。本发明以产胆固醇的酿酒酵母为宿主菌,构建了含有来源于盾叶薯蓣植物的薯蓣皂素合成通路三个基因的重组工程菌,重组工程菌能够氧化胆固醇生成薯蓣皂素,实现了在酵母细胞中异源生物合成薯蓣皂素,为解决植物提取法生产薯蓣皂素存在的生产成本高、环境污染大等问题提供了有效的方法,具有较好的应用前景。