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[发明专利]基于微生物代谢背景的宏基因组队列匹配方法-CN202310748085.0在审
发明人：吴顶峰;刘蕾;曹苏琪;杨柳;俞刚;李竞 -专利权人：浙江大学医学院附属儿童医院
申请日： 2023-06-25 - 公布日： 2023-10-10 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明公开了基于微生物代谢背景的宏基因组队列匹配方法，涉及宏基因组技术领域。S1：宏基因组测序数据处理；对来自全宏基因组学的数据和手动输入的meta数据进行标准化处理；S2：微生物主要代谢背景提取；S3：微生物代谢背景匹配；首先通过最近邻匹配算法在不遗漏任何主要代谢成分的情况下，筛选对照组中匹配的样本；S4：匹配效果检查；对匹配后的疾病组和对照组的协变量均值进行平衡性检验；S5：基于匹配队列的差异分析；匹配后的疾病组和对照组数据符合正态分布，则进行配对样本t检验进行差异分析，否则使用成组wilcoxon检验进行差异分析。通过本技术方法，实现微生物研究中病例和对照样本匹配队列的构建，加强宏基因组学研究的因果关系识别能力。
基于微生物代谢背景宏基组队匹配方法

[发明专利]一种环肽数据管理平台及其设计方法-CN202310748230.5在审
发明人：吴顶峰;刘蕾;杨柳;曹苏琪;俞刚;李竞 -专利权人：浙江大学医学院附属儿童医院
申请日： 2023-06-25 - 公布日： 2023-10-10 - 主分类号： G16C20/90 文献下载
摘要：本发明公开了一种环肽数据管理平台及其设计方法，涉及计算机技术领域，其技术方案要点是：包括数据库、服务器、数据采集模块、缺失处理模块、数据浏览模块、更新校对模块、数据检索模块、统计分析与可视化模块、数据下载模块。通过整合已有环肽数据，建立集成环肽理化性质、生物活性、合成信息、临床试验等数据的专业型数据管理和可视化平台。数据平台维护及扩展方便，对于系统本身的维护，只需要在服务器端进入本数据平台可以即时对数据库和系统功能进行修改或添加，随着环肽的发现和信息的增加，可根据具体倩况进行系统功能的扩展。
一种环肽数据管理平台及其设计方法

[发明专利]一种可解释的乳腺癌血液miRNA诊断系统构建的方法-CN202310039434.1在审
发明人：吴顶峰;杨柳;曹苏琪 -专利权人：浙江大学医学院附属儿童医院
申请日： 2023-01-13 - 公布日： 2023-05-26 - 主分类号： G16H50/20 文献下载
摘要：本发明公开了医疗人工智能技术领域的一种可解释的乳腺癌血液miRNA诊断系统构建的方法，包括以下步骤：S1，数据获取：获取乳腺癌患者与非乳腺癌患者血液miRNA测序数据；S2，数据预处理：将乳腺癌组作为阳性数据，非乳腺癌组作为阴性数据；S3，构建模型：将阴性和阳性数据分为训练集和测试集，并基于训练组构建模型；S4，模型效能评估：对模型预测性能进行评估；S5，模型解释应用：解析BioDecoder中的miRNA生物解码途径。该方法大大提高了乳腺癌早期诊断的准确性和灵敏度，并实现高效、精准的人工智能乳腺癌血液诊断以及治疗方向参考，能够解决目前乳腺癌早期预测手段缺乏、难以普及等问题。
一种可解释乳腺癌血液 mirna 诊断系统构建方法

[发明专利]一种肺炎患儿预后风险标志物的筛选与恶性分级方法、系统及其标志物和应用-CN202211245290.7在审
发明人：吴顶峰;曹苏琪;焦娜;杨柳 -专利权人：浙江大学医学院附属儿童医院
申请日： 2022-10-12 - 公布日： 2023-02-03 - 主分类号： G16H50/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种肺炎患儿预后风险标志物的筛选与恶性分级方法、系统及其标志物和应用，基于临床检验指标数据，包括血液、尿液及粪便检测，并从中筛选出最优的预后风险标志物，以此构建基于机器学习技术的儿童肺炎预后模型，并根据最佳截断值对患儿进行恶性分级。该模型大大提高了肺炎患儿预后预测的特异性和灵敏度并实现高效、精准的人工智能肺炎患儿预后恶性分级，能够解决目前肺炎患儿预后评估手段缺乏、价格昂贵、无法推广普及等问题。
一种肺炎预后风险标志筛选恶性分级方法系统及其应用