本发明公开了一种融合碳端的重组蛛丝蛋白及其制备方法与基于重组蛛丝蛋白的载药微球,属于蛋白制备领域。融合碳端的重组蛛丝蛋白由8个重复核心序列和碳端序列组成,重组蛛丝蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。为了实现重组蛛丝蛋白的简易表达,本发明将该重组蛛丝蛋白MaSp2(8R)+CT克隆在载体pCold I上,实现了无需克隆甘氨酸‑tRNA的编码序列就能成功诱导表达了重组蛛丝蛋白,并提供了纯化载体pCold I上重组蛛丝蛋白的方法。本发明提供的基于重组蛛丝蛋白的载药微球,相比于现有的载药微球,毒性更小,载药率和释放率更高,具有很好的应用前景。