一种猪全基因组低密度SNP芯片，其为SEQ ID NO.1‑8846序列中所示的DNA序列。其有益效果为本发明的猪全基因组低密度SNP芯片从现有的80k芯片中通过研究分析，创造性的在不显著降低选择准确性的情况下，去除无关SNP标记，将其降低到8846个。对在猪育种选育方面具有开创性意义，使得通过猪全基因组低密度SNP芯片普及猪的分子育种成为可能，将大大提高我国猪育种选育进程。
本发明提供了一种检测牛APAF1基因隐性致死突变的方法，涉及分子生物学领域，本发明方法基于焦磷酸测序技术，采用一对扩增引物、一条通用引物和一条测序引物，其核苷酸序列如SEQ ID No.1、2、3、4所示，对牛5号染色体63150400bp位点的单核苷酸多态性进行分析，结果发现牛APAF1基因野生型纯合子在C碱基处有峰，T碱基处无峰；而致死突变携带者在C碱基与T碱基处均有峰。本发明提供的方法操作简单，灵敏度高，准确性强，通量高，检测成本低，可快速检测APAF1基因隐性致死突变携带者的个体，在牛的育种过程中具有重要应用价值。
本发明提供了一种检测牛SMC2基因隐性致死突变的方法，涉及分子生物学领域，本发明方法基于焦磷酸测序技术，采用一对引物、一条通用引物和一条测序引物，核苷酸序列如SEQ ID No.1、2、3、4所示，对牛8号染色体95410507bp位点的单核苷酸多态性进行分析，结果发现野生型纯合子在突变位点处为T/T基因型，焦磷酸测序结果图显示T碱基与C碱基的峰高比例为3:1；而致死突变携带者峰图在突变位点处为T/C基因型，焦磷酸测序结果图显示T碱基与C碱基的峰高比例为5:3。本发明提供的方法操作简单，灵敏度高，准确性强，通量高，检测成本低，在牛的保种、育种过程中具有重要应用价值。
