本发明涉及一种SSR分子标记鉴定引物及其应用。该SSR分子标记鉴定引物,包括引物对N,引物对N包括SEQ ID NO.2N‑1至SEQ ID NO.2N所示的序列,其中,N选自1至26之间的任意整数;和/或多个引物对N的组合,引物对N包括SEQ ID NO.2N‑1至SEQ ID NO.2N所示的序列,其中,N选自1至26之间的任意不同整数。利用该SSR分子标记可以构建杨树品种DNA指纹图谱,具有稳定可靠、结果准确、快速简便,不受生长季节限制和树龄差异的影响等优点,为杨树品种的鉴定提供了科学依据。