本发明涉及生物育种技术领域,具体公开了一种与番鸭产蛋相关的SNP位点及其应用。所述SNP位点为SEQ ID NO:1所述序列中的第231处的T/C突变。本发明首次发现与番鸭产蛋性质相关的SNP位点,并以该位点发现了SEQ ID NO:1所述序列中的第231位TT基因型的番鸭产蛋量较高,为本领域技术人员提供了一种高效筛选高产蛋番鸭的方法。检测方法周期短,速度快。从拿到待检个体血样到决定被检个体的选淘只需要2天时间,每人每天至少可以完成144个体的检测。另外,检测方法准确率100%。由于该方法是检测与产蛋紧密连锁的突变的基因型,因此该方法可以做到100%的准确。