本发明公开了一种番茄青枯病抗性基因Slα‑KGDH E2及其应用。Slα‑KGDH E2编码α‑酮戊二酸脱氢酶E2亚基,该基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,该基因编码的蛋白质序列如SEQ ID NO:2所示。该基因的表达量下降或部分碱基突变均可使番茄植株丧失对番茄青枯病的抗性。抗病植株中接种青枯菌后,Slα‑KGDH E2基因表达量较对照显著提高;功能验证表明Slα‑KGDH E2基因在番茄对青枯菌抗性中具有关键的正向调控作用,可以通过超量表达Slα‑KGDH E2基因提高番茄对青枯病抗性,其为番茄抗病新品种的选育提供了新途径,因而有良好的应用价值。