本发明公开了一种石斑鱼放流群体鉴别微卫星标记的特异性引物,所述特异性引物为12对,包括7对三碱基重复序列GRTR‑1~GRTR‑7的特异性引物和5对四碱基重复序列GRQU‑1~GRQU‑5的特异性引物,其中三碱基重复序列GRTR‑1~GRTR‑7的特异性引物的碱基序列如SEQ ID No:1~14所示,四碱基重复序列GRQU‑1~GRQU‑5的特异性引物的碱基序列如SEQ ID No:15~24所示。还公开了一种石斑鱼放流群体鉴别的方法,以及上述特异性引物在石斑鱼放流群体的亲子鉴定、群体鉴别以及遗传育种和放流效果评估中的应用。