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- [发明专利]一种捕获cfDNA5mC片段的检测方法-CN202110844659.5在审
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钟晟;胡新蕾;严晓芹;闫子玥
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深圳泰莱生物科技有限公司
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2021-07-26
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2021-10-29
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C12Q1/6804
- 本发明公开了一种捕获cfDNA5mC片段的检测方法,包括以下步骤:步骤一:准备试剂;步骤二:制备Incubation Mix,在4℃下操作;步骤三:抗体Antibody稀释1:15,抗体放置在‑80℃,0.5ul抗体+7.5ulH2O(过量),抗体用完后及时放回‑80℃;步骤四:Antibody Mix制备,过量,2个样品一般制备3个的量;步骤五:Incubation Mix+Antibody Mix混合,4℃转速40旋转孵育过夜,17h;步骤六:Ipure Kit v2试剂准备。该种捕获cfDNA5mC片段的检测方法,胞嘧啶第五碳的甲基化(5‑甲基胞嘧啶:5mC)是最早在真核生物中被挖掘出的甲基化类型,在基因表达中,转录起始位点区域通常是非甲基化的,而在基因较低水平表达时,调控区域的胞嘧啶甲基化水平较高,不同起始量和不同方法所产生的文库相关性,是评估一致性和高性能的有效参数。
- 一种捕获cfdna5mc片段检测方法
- [发明专利]一种多重巢式PCR方法-CN202110830790.6在审
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钟晟;胡新蕾;严晓芹;闫子玥
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成都泰莱医学检验实验室有限公司
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2021-07-22
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2021-10-26
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C12Q1/6886
- 一种多重巢式PCR方法,涉及基因标志物检测技术领域,本发明利用多重PCR和巢式PCR相结合,利用3种目的基因的基因标志物,设计全新的PCR引物,针对cfDNA5hmC富集捕获文库,使用touchdownPCR及热启动PCR方法进行多重巢式PCR扩增,避免PCR过程中引物二聚体、发夹结构的形成,保证了PCR扩增的特异性,进而完成靶序列的富集,得到二代测序靶向测序文库;通过对3个目的基因区域和1个基因间区域的羟甲基化状态的高效检测,实现在较低测序深度下完成对基因标志物中5hmC含量的检测,从而大幅降低测序成本,成为一种高效率、低成本的肝癌早期诊断检测手段。
- 一种多重pcr方法
- [发明专利]一种捕获cfDNA5hmC片段的检测方法-CN202110846330.2在审
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钟晟;胡新蕾;严晓芹;闫子玥
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深圳泰莱生物科技有限公司
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2021-07-26
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2021-10-22
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C12Q1/6806
- 本发明公开了一种捕获cfDNA5hmC片段的检测方法,包括以下步骤:步骤一:预先准备需要使用的试剂,置于冰上,建立体系,温度时间为37℃、2h;步骤二:加入2.5μlDBCO‑PEG4‑biotin,37℃,孵育2h;步骤三:再使用MicroBio‑spin30column(Bio‑Rad)纯化;步骤四:取5μlCI磁珠,吹打均匀后置于磁力架上,待澄清后吸走上清液,加50μl的2*buffer1在旋转架上孵育3min后。该种捕获cfDNA5hmC片段的检测方法,利用链霉亲和素涂层磁珠扩增生物素化的DNA片段。该磁珠可以进行“下拉”分析,将具有5hmC的DNA分子与没有生物标记的DNA分子分离,通过对目标片段进行测序和生物信息学分析,最终获得表观遗传标记,很大程度上提高了5hmC捕捉的效率。
- 一种捕获cfdna5hmc片段检测方法
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