本发明提供一种用于鉴定小麦背景中黑麦1R染色体短臂(1RS)的分子探针及其应用。本发明利用黑麦1RS臂核仁组织区特异的寡核苷酸探针(SEQ ID NO:1)，可以将1RS臂与小麦染色体区分开，也能将1RS臂与其它黑麦染色体臂区分开。将简单的间期核制备与ND‑FISH技术相结合检测小麦背景中的1RS臂和以小麦‑黑麦1BL.1RS易位系为亲本的杂交后代中的1BL.1RS易位染色体。整个操作过程简短高效，从而加快小麦育种进程。
本发明提供了一种快速鉴定普通小麦A、B、D基因组染色体的方法。本发明首先提供3条寡核苷酸探针，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1‑3所示，探针SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2能够分别在小麦B和D基因组染色体上产生全覆盖式的明显清晰的信号，探针SEQ ID NO.3在A基因组染色体上产生明显清晰的信号。将3条探针相结合用于ND‑FISH，能同时将普通小麦A、B、D基因组染色体截然地区分开，还能鉴定发生在小麦中的染色体组间易位的染色体，具有操作简便、用时短、成本低的优点。在小麦育种领域具有良好的应用前景。
本发明提供了一种快速鉴定小麦背景中簇毛麦染色体的方法。本发明首先提供2条寡核苷酸探针，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1‑2所示，将2条探针混合，结合ND‑FISH技术，可用于鉴定小麦与簇毛麦杂交后代中的簇毛麦染色体，能清楚地区分小麦染色体和簇毛麦染色体的同时，准确识别7条簇毛麦染色体，并且能鉴定小麦‑簇毛麦易位染色体。本发明方法能克服GISH和现有ND‑FISH技术的缺点，又能达到GISH和现有ND‑FISH技术的效果，方便鉴定小麦‑簇毛麦易位染色体，在小麦育种领域具有良好的应用前景。
本发明公开了一种小麦‑长穗偃麦草抗赤霉病易位系的选育方法及分子标记。同时，本发明还提供扩增该分子标记的引物、该分子标记在小麦遗传育种中的应用。所述分子标记是如下的分子之一：(1)序列如SEQ ID NO.1所示的核酸分子；或(2)序列如SEQ ID NO.2所示的核酸分子；或(3)序列如SEQ ID NO.3所示的核酸分子。本发明对于小麦遗传育种的理论研究和实际应用均有重要价值。
本发明涉及生物技术领域，具体来说是一种检查黑麦染色体的寡核苷酸探针及该探针的制备方法，探针序列如SEQ ID NO:1所示；获得方法包括：(1)用Slaf-seq方法对黑麦基因组DNA进行测序，获得大量长度为120bp的reads；(2)用生物信息学方法从测得的序列中找到高度重复的序列，从这些高度重复的序列中，选取长度在60bp以下的寡核苷酸，用作探针合成；(3)将初步筛选出的寡核苷酸序列送到公司进行探针合成；(4)探针合成后，逐条进行FISH试验，验证探针的功能；(5)确定正确的寡核苷酸探针。本发明获得的探针序列能起到应有的功能，使鉴定小麦背景中的黑麦染色体的实验变得简便易行，且实验成本大大降低。
