本发明公开了一种利用CsWRKY43干扰以提高柑橘溃疡病抗性的方法,采用RNA干扰(RNAi)降低柑橘属植物中CsWRKY43的转录水平,其中,CsWRKY43编码基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;具体包括以下步骤:(1)克隆柑橘CsWRKY43编码基因的RNAi片段;(2)构建CsWRKY43基因片段的干扰表达载体;(3)干扰表达载体转化柑橘,得到转基因植株。本发明通过克隆柑橘CsWRKY43编码基因的RNAi片段,构建干扰载体,然后转化柑橘,得到的转基因植株溃疡病病斑面积可最大降低至现有柑橘的64%,病情指数可最大降低至现有柑橘的61%,能够显著的减轻溃疡病的发病程度。