本发明公开了一种表达羰基还原酶的重组工程菌及其应用,该工程菌包括宿主细胞和转入宿主细胞的重组载体,所述重组载体由原始载体及接入原始载体的目的基因构成,所述宿主细胞为大肠杆菌(Escherichiacoli)Rosetta(DE3),所述的目的基因为羰基还原酶基因,碱基序列如SEQ ID NO.1所示。本发明重组工程菌羰基还原酶表达水平较高,利用诱导培养的菌体细胞将氮,氮-二甲基-3-氧基-3-(2-噻吩)-l-丙胺盐酸盐转化为(S)-氮,氮-二甲基-3-羟基-3-(2-噻吩)-l-丙胺;或将4-氯乙酰乙酸乙酯转化为(S)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯,两种产物的光学纯度及转化率均较高。