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[发明专利]一种用于预测泛素化酶与底物关联的方法及模型-CN202310787704.7在审
发明人：王佳;潘贵青;黄裕安;林秋镇;李坚强 -专利权人：深圳大学
申请日： 2023-06-29 - 公布日： 2023-10-24 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于预测泛素化酶与底物关联的方法及模型，所述方法通过获取泛素化酶蛋白质数据和底物蛋白质数据；根据泛素化酶蛋白质数据和底物蛋白质数据分别确定泛素化酶特征向量和底物特征向量；获取泛素化酶和底物对应的初始映射关系，根据初始映射关系、泛素化酶特征向量以及底物特征向量确定泛素化酶和底物对应的目标映射关系。由于本发明通过获取泛素化酶蛋白质数据和底物蛋白质数据，并根据泛素化酶蛋白质数据和底物蛋白质数据预测泛素化酶和底物之间的目标映射关系，涉及的生物数据类型以及生物学知识较少，因此可以有效地解决现有技术对于领域知识的依赖较强，且需要多种类型的生物数据，使得模型难以得到推广应用的问题。
一种用于预测泛素化酶关联方法模型

[发明专利]一种用于预测转录因子-靶基因相互作用的方法及模型-CN202111493609.3在审
发明人：黄裕安;潘贵青;王佳;林秋镇;李坚强 -专利权人：深圳大学
申请日： 2021-12-08 - 公布日： 2022-04-29 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开的一种用于预测转录因子‑靶基因相互作用的方法及模型，所述用于预测转录因子‑靶基因相互作用的方法是基于随机游走的异构图嵌入算法来预测TF与靶基因潜在的相互作用关系，采用随机游走方式在异构图中生成节点的语句，然后采用滑动窗口方式提取训练样本，经过异构图嵌入算法生成节点的特征，进而预测TF与靶基因之间未被发现的相互作用关系。并且，由于本发明在异构图中添加了TG节点，采用随机游走生成样本路径的过程中，在选择TG或者疾病节点时，设定一个概率，以一定概率选择TG或者疾病，在解决冷启动问题的同时，能够更好地捕获异构网络的节点信息。
一种用于预测转录因子基因相互作用方法模型

[发明专利]备选轨迹评价方法及装置-CN202110229336.5在审
发明人： 潘贵青;刘冬薇;徐成;张放;李晓飞;王肖;张德兆;霍舒豪 -专利权人：重庆智行者信息科技有限公司
申请日： 2021-03-02 - 公布日： 2021-06-25 - 主分类号： G06F16/29 文献下载
摘要：本发明提供了一种备选轨迹评价方法及装置，方法包括：获取备选路径集合和备选速度集合；备选路径集合包括多个备选路径，备选速度集合包括多个备选速度；根据多个备选路径和多个备选速度，确定备选轨迹集合；备选轨迹集合包括多条备选轨迹；确定备选轨迹的多个属性，并确定每个属性的隶属度函数；根据隶属度函数，计算每条备选轨迹的多个属性中的每个属性的评价模糊数；每个评价模糊数包括隶属度和非隶属度；根据每个属性的评价模糊数的隶属度和非隶属度，通过模糊数集成算子计算每条备选轨迹的综合属性模糊数；根据综合属性模糊数，确定每条备选轨迹的综合得分；根据每条备选轨迹的综合得分，确定最优轨迹。
备选轨迹评价方法装置