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[发明专利]基因测序结果类型的检测方法、装置、设备及存储介质-CN201810675765.3有效
发明人：赵文妍;段广有;金亮;闵文波;顾思健;葛毅;廖国娟 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2018-06-27 - 公布日： 2023-10-03 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明实施例公开了一种基因测序结果类型的检测方法、装置、设备及存储介质。所述方法包括：获取待测基因测序结果的峰形图；根据所述峰形图提取所述待测基因测序结果对应的特征数据；将所述特征数据输入至类型检测模型中，得到与所述待测基因测序结果相匹配的类型。通过本发明实施例的技术方案，能够对基因测序结果的类型进行自动判定，节约人力、物力和财力，提高判定效率和准确率。
基因结果类型检测方法装置设备存储介质

[发明专利]电泳图的识别方法、装置、设备及存储介质-CN201910299112.4有效
发明人：赵文妍;丁砚书;段广有;闵文波;葛毅;廖国娟 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2019-04-15 - 公布日： 2023-06-27 - 主分类号： G06T7/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种电泳图的识别方法、装置、设备及存储介质，通过获取当前样本的电泳图，并识别出电泳图中的胶图图像的边框；其中，所述胶图图像包括至少一个条带图像，然后提取每个条带图像中预设数量的像素值构成目标像素矩阵；最后将目标像素矩阵输入预先训练的预测模型，以得到当前样本的目标加样量。本实施例的技术方案，采用图像识别的技术对电泳图进行识别，并形成条带的像素矩阵，输入到预先训练的预测模型中，预测模型输出该样本后续试验时的加样量。这样可以使得电泳图的识别结果有一个统一的规范，避免了由于人工判断与识别带有一定的主观性，导致电泳图中胶图的识别结果存在差异的问题。
电泳识别方法装置设备存储介质

[发明专利]一种样本处理方法及设备-CN202010807364.6在审
发明人：赵文妍;段广有;闵文波;方其;张艳;葛毅;廖国娟 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2020-08-12 - 公布日： 2020-11-20 - 主分类号： C12Q1/6874 文献下载
摘要：本发明实施例公开了一种样本处理方法及设备，该方法包括：为每个样本分配至少一条测试通道，所有样本基于分配的测试通道形成多个样本排列集合；从多个样本排列集合中筛选出符合第一设定条件的至少两个样本排列集合；将筛选出每两个样本排列集合中的测试通道进行交叉互换，并将交叉互换后的样本排列集合进行测试通道的变异，得到多个新样本排列集合以及将每个新样本排列集合作为样本排列集合；返回从多个样本排列集合中筛选出符合第一设定条件的至少两个样本排列集合操作，直至达到终止条件为止，则选择符合第二设定条件的样本排列集合作为最终的样本排列集合，可以快速准确地给出样本在测序芯片中的测试通道排列的情况，提高效率。
一种样本处理方法设备

[发明专利]一种基因序列难度分析模型的构建方法及其应用-CN201911337248.6在审
发明人：赵文妍;段广有;丁砚书;方其;张艳;葛毅;廖国娟 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2019-12-23 - 公布日： 2020-05-22 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种基因序列难度分析模型的构建方法及其应用，包括：取已知序列难度的不同基因序列若干，作为建模的数据库；对所述数据库中的基因序列进行序列特征提取；将所述序列特征与所述已知序列难度利用回归算法建立定量预测模型；发明人在生产过程中，发现待测序列基因序列的难度无法预测，进而难以满足客户对于基因合成周期需求，同时在大量待合成基因序列存在的情况下，无法进行有效的统筹安排，降低了基因合成的效率，因此，发明人研究发现，将已知序列难度的基因序列的特征与已知序列难度利用回归算法构建的模型可以准确预估基因序列的难度，以预测待测基因合成的周期。
一种基因序列难度分析模型构建方法及其应用

[发明专利]一种序列自动拼接方法及装置-CN201710104162.3有效
发明人： 段广有;金亮;徐凤丹;廖国娟;葛毅 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2017-02-24 - 公布日： 2019-07-26 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种序列自动拼接方法及装置，该方法包括以下步骤：S1：获取测序样本并对其进行预处理，所述测序样本包括多个测序数据序列；S2：计算每个测序数据序列的长度，选择长度最长的测序数据序列并记为起始序列；S3：从其余测序数据序列中选择一个并记为待拼接序列；S4：将所述起始序列与所述待拼接序列进行比对；S5：当该起始序列与所述待拼接序列存在长度大于预设值M的公共子串时，则将该起始序列与该待拼接序列进行拼接并得到一拼接序列，并将该拼接序列记为新的起始序列；S6：判断是否还有测序数据序列未拼接，若是，则依次执行S3、S4和S5；若否，则执行S7；S7：生成测序结果文件。本发明大大提高了拼接结果的准确性。
一种序列自动拼接方法装置

[发明专利]一种猪全基因组sgRNA文库及其构建方法和应用-CN201711490244.2在审
发明人：许朋阳;徐凤丹;段广有;闵文波;夏步高;葛毅 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2017-12-29 - 公布日： 2018-06-29 - 主分类号： C40B40/06 文献下载
摘要：本发明提供了一种猪全基因组sgRNA文库及其构建方法和应用，所述文库包括猪(Sus scrofus)全基因组中20438个基因的sgRNA序列，其中17410个基因设计得到6条sgRNA，2828个基因设计得到sgRNA数量在1‑5条之间，所述sgRNA的获取过程为：首先在靶序列上获取候选sgRNA，然后对候选sgRNA进行脱靶分析并打分，最后根据打分结果对sgRNA过滤；本发明通过采用多种设计标准及筛选原则，优化模块内细节及流程，最终构建得到猪全基因组sgRNA文库，所述方法简洁高效，得到的文库质量高，活性好，便于应用在基因编辑研究中。
文库全基因组构建基因设计种猪应用设计标准优化模块靶序列基因过滤筛选分析研究

[发明专利]一种全基因组sgRNA文库的构建系统及其应用-CN201711481306.3在审
发明人：徐凤丹;金亮;许朋阳;段广有;赵文妍;葛毅 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2017-12-29 - 公布日： 2018-06-26 - 主分类号： G06F19/16 文献下载
摘要：本发明提供了一种全基因组sgRNA文库的构建系统及其应用，所述系统包括输入模块、sgRNA设计模块和sgRNA过滤模块，通过构建系统的三大模块，优化模块内细节及流程，采用多种设计标准及筛选原则，最终构建得到全基因组sgRNA文库，所述系统及方法简洁高效，得到的文库质量高，活性好，便于应用在基因编辑研究中。
文库构建系统全基因组应用过滤模块设计标准设计模块输入模块优化模块构建筛选基因研究

[发明专利]一种基因编码序列的优化方法及装置-CN201710089460.X在审
发明人： 段广有;徐凤丹;金亮;廖国娟;葛毅 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2017-02-20 - 公布日： 2017-07-14 - 主分类号： G06F19/14 文献下载
摘要：本发明公开了一种基因编码序列的优化方法及装置，方法包括生成M个基因编码序列，作为初代群体P(0)，其中，M为大于1的整数；计算当代群体中每个基因编码序列的适应度；判断是否达到终止计算条件；当未达到终止计算条件时，对第t代群体P(t)的基因编码序列进行选择、交叉和变异运算，得到第t+1代群体P(t+1)，返回执行计算当代群体中每个基因编码序列的适应度的步骤，t取0、1、2…；当达到终止计算条件时，选择适应度最大的基因编码序列作为优化后的基因编码序列。本发明通过采用遗传算法对基因编码序列进行优化，对于根据用户需求设置的参数采用加权求和的方式计算基因编码序列的适应度，使得优化后的基因编码序列满足用户的需求。
一种基因编码序列优化方法装置

[发明专利]生物序列分析平台及其使用方法-CN201110456784.5有效
发明人： 段广有;孙中平;廖国娟;杨平;柳伟强;韩晓敏;张园园 -专利权人：苏州金唯智生物科技有限公司
申请日： 2011-12-31 - 公布日： 2012-08-15 - 主分类号： G06F19/16 文献下载
摘要：本发明揭示了一种生物序列分析平台，包括计算机，所述计算机包括用户界面，还包括：输入模块，用于在所述用户界面上手动输入待分析的生物序列，或者上传记载有所述生物序列的格式可读的文件；分析模块，用于将所述输入模块获得的所述生物序列进行分析，得到分析结果；输出模块，用于将所述分析模块得到的分析结果显示在所述用户界面上，和/或将所述分析结果导出并至该生物序列分析平台外部预先定义的外部文件中进行保存。本发明界面简洁，实现了一站式分析，节省了大量的人力、物力，同时加入了批量处理模块，加强了结果的可视化以及结果的保存，以便后续的分析查看；在分析过程中对强力搜索算法也进行了改进，缩短了相应的分析时间。
生物序列分析平台及其使用方法

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