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[发明专利]针对靶向药物EGFR通路的酪氨酸激酶抑制剂的多肽疫苗组合及其设计方法-CN202011331275.5有效
发明人：莫凡;马治明;林志伟;韩宁;陈荣昌;周秀卿 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2019-01-29 - 公布日： 2023-08-18 - 主分类号： A61K39/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种针对靶向药物EGFR通路的酪氨酸激酶抑制剂的多肽疫苗组合及其设计方法，设计方法包括如下步骤：收集靶向药物耐药突变数据；截取耐药突变多肽序列截取及预测MHC分子亲和力及免疫原性；靶向药物与耐药位点相互关系及药物聚类；人工设计相对应的疫苗多肽序列；通过这样的设计方法得到的靶向药物联合多肽疫苗组合能够覆盖常见的靶向治疗药物，可以有效降低肿瘤耐药发生概率，延长靶向药有效作用时间，增加患者的疾病响应率，具有广谱性，缩短个体化多肽疫苗从分析到治疗的时间，降低医疗成本。
针对靶向药物 egfr 通路酪氨酸激酶抑制剂多肽疫苗组合及其设计方法

[发明专利]一种HLAI型分子与多肽的亲和力预测方法-CN201911411222.1有效
发明人：莫凡;孙英强;王奎;陈荣昌;王慧敏;韩宁 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2019-12-31 - 公布日： 2023-07-21 - 主分类号： G16B5/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种HLA I型分子与多肽的亲和力预测方法，本发明将各种算法优势进行了系统整合，通过IEDB数据库、文献调研收集所得数据集以及实验产生数据集整合成数据库；对数据集中各个HLA分型所对应的肽段通过多种编码混合的转换方式进行数值型转换；得到最终的训练数据集；根据对不同学习器组合不同编码方式的深入研究及对数据特性的分析，本发明整合多种算法的混合模型，学习多肽序列的特征，既保证了单一分型在机器学习算法上训练的独立性，又保证了各HLA分型之间在深度学习算法上预测的互补性，从而实现对多肽与特定HLA分子亲和力的预测；本发明利用多个机器学习工具的组合实现了准确预测患者肿瘤中的新生抗原。
一种 hlai 分子多肽亲和力预测方法

[发明专利]一种筛选新生抗原或新生抗原编码序列的方法-CN202011134511.4有效
发明人：杨晓月;刘亮;邱旻;韩宁;莫凡 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2020-10-21 - 公布日： 2022-12-13 - 主分类号： C12Q1/04 文献下载
摘要：本发明公开了一种筛选新生抗原或新生抗原编码序列的方法，将待筛选新生抗原编码序列插入到原始表达载体中获得重组表达载体，然后转染未成熟的DC细胞，培养转染后的DC细胞使DC细胞成熟，成熟的DC细胞表面表达有相应的新生抗原表位肽，由成熟的DC细胞将新生抗原表位肽递呈给T细胞，诱导T细胞活化为效应T细胞，再将效应T细胞与肿瘤细胞共培养，筛选杀伤肿瘤细胞效果好的效应T细胞，从而筛选出免疫原性好的新生抗原，对应的编码序列即为筛选到的免疫原性好的新生抗原编码序列。本发明筛选新生抗原或新生抗原编码序列的方法，可以快速筛选得到免疫原性强的新生抗原，且其对应的野生型肽不具有免疫原性，这类的新生抗原是疫苗的最佳选择。
一种筛选新生抗原编码序列方法

[发明专利]一种个体信息和诊疗信息的存储方法-CN202211055165.X在审
发明人：莫凡;陈相剑;邱旻 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2022-08-31 - 公布日： 2022-11-29 - 主分类号： G16H10/60 文献下载
摘要：本发明公开了一种个体信息和诊疗信息的存储方法，包括如下步骤：整理患者健康管理、诊断和治疗每个步骤产生的关键信息对象，以及它们之间的关联关系，并依据形成的关系网络进行建模；基于建模结果设立节点，并在相互关联的节点间建立代表关系的边，以便后续进行实际数据存储；从待提取信息的数据库，电子表格文件、原始数据文件或数据接口信息来源中抽提出待存储于节点和边上的数据，并将这些数据存储于图数据库的节点或边中；本发明能够显著缩小记录信息所需的存储空间，减少信息查询时间，使得回溯信息更为方便，与传统信息存储方法相比，该方法使得数据构架的调整更改更为灵活便捷，能够节省人力物力。
一种个体信息诊疗存储方法

[实用新型]一种避光孵育箱-CN202123300063.3有效
发明人：黄勤学 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2021-12-21 - 公布日： 2022-10-28 - 主分类号： G01N33/53 文献下载
摘要：本申请提供一种避光孵育箱，该避光孵育箱包括箱体和开设于箱体内的至少一个样品孵育仓，本方案将不透光的第一仓门可活动地设置在箱体上表面，以打开或闭合样品孵育仓，从而该样品孵育仓在第一仓门闭合进行样品孵育时，可以随时通过打开第一仓门来观察样品情况，而不会触动样品孵育仓，无需频繁移动样品本身。
一种避光孵育

[发明专利]一种肿瘤新生抗原及靶向药信息的存储方法-CN202210592774.2在审
发明人：莫凡;陈相剑;邱旻 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2022-05-27 - 公布日： 2022-09-13 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种肿瘤新生抗原及靶向药信息的存储方法，包括如下步骤：整理肿瘤新生抗原及靶向药信息的分析过程，理清分析流程中每个步骤产生的关键信息对象，以及它们之间的关联关系，并依据形成的关系网络进行建模；基于建模结果设立节点，并在相互关联的节点间建立代表关系的边，以便后续进行实际数据存储；从待提取信息的数据库，电子表格文件、原始数据文件或数据接口信息来源中抽提出待存储于节点和边上的数据，并它们分别存储于图数据库对应的节点或边中。本发明能够显著缩小记录信息所需的存储空间，减少信息查询时间，使得回溯信息更为方便，与传统信息存储方法相比，该方法使得数据构架的调整更改更为灵活便捷，能够节省人力物力。
一种肿瘤新生抗原靶向信息存储方法

[发明专利]复合纳米疫苗及其制备方法、组合疫苗及其制备方法-CN202210387647.9在审
发明人：莫凡;邱旻 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2022-04-13 - 公布日： 2022-07-22 - 主分类号： A61K39/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种延缓肿瘤耐药性产生的肿瘤疫苗，属于肿瘤疫苗技术领域。一种复合纳米疫苗，包括改性耐药突变抗原多肽、鱼精蛋白以及佐剂；所述改性耐药突变抗原多肽是通过酸性氨基酸片段修饰耐药突变抗原多肽而获得的；所述耐药突变抗原多肽选自针对会导致肿瘤细胞对七类肿瘤靶向药物中的任一种药物产生耐药性的任一种基因突变而通过人工设计和/或多肽疫苗设计软件设计得到的相对应的耐药突变抗原多肽。本发明通过激活抗原特异性T细胞，促使T细胞杀伤带有耐药突变抗原的肿瘤细胞，从而避免或延缓肿瘤对肿瘤靶向药物产生耐药性，显著延长肿瘤靶向药物的有效作用时间。
复合纳米疫苗及其制备方法组合

[发明专利]针对靶向药物依鲁替尼的多肽疫苗组合及其设计方法-CN202011328455.8有效
发明人：莫凡;马治明;林志伟;韩宁;陈荣昌;周秀卿 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2019-01-29 - 公布日： 2022-07-15 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种针对靶向药物依鲁替尼的多肽疫苗组合及其设计方法，设计方法包括如下步骤：收集靶向药物耐药突变数据；截取耐药突变多肽序列截取及预测MHC分子亲和力及免疫原性；靶向药物与耐药位点相互关系及药物聚类；人工设计相对应的疫苗多肽序列；通过这样的设计方法得到的靶向药物联合多肽疫苗组合能够覆盖常见的靶向治疗药物，可以有效降低肿瘤耐药发生概率，延长靶向药有效作用时间，增加患者的疾病响应率，具有广谱性，缩短个体化多肽疫苗从分析到治疗的时间，降低医疗成本。
针对靶向药物依鲁替尼多肽疫苗组合及其设计方法

[发明专利]针对靶向药物PI3K、AKT、mTOR通路的激酶抑制剂的多肽疫苗组合及其设计方法-CN202011331358.4有效
发明人：莫凡;马治明;林志伟;韩宁;陈荣昌;周秀卿 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2019-01-29 - 公布日： 2022-07-12 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种针对靶向药物PI3K、AKT、mTOR通路的激酶抑制剂的多肽疫苗及其设计方法，设计方法包括如下步骤：收集靶向药物耐药突变数据；截取耐药突变多肽序列截取及预测MHC分子亲和力及免疫原性；靶向药物与耐药位点相互关系及药物聚类；人工设计相对应的疫苗多肽序列；通过这样的设计方法得到的靶向药物联合多肽疫苗组合能够覆盖常见的靶向治疗药物，可以有效降低肿瘤耐药发生概率，延长靶向药有效作用时间，增加患者的疾病响应率，具有广谱性，缩短个体化多肽疫苗从分析到治疗的时间，降低医疗成本。
针对靶向药物 pi3k akt mtor 通路激酶抑制剂多肽疫苗组合及其设计方法

[发明专利]免疫肽的鉴定方法、终端设备和可读存储介质-CN202210348793.0在审
发明人：莫凡;符芳妮 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2022-04-01 - 公布日： 2022-07-05 - 主分类号： G01N30/72 文献下载
摘要：本申请公开了免疫肽的鉴定方法Alpha‑DDA、终端设备、可读存储介质和肽段标记方法在免疫肽的鉴定领域的应用，涉及生物信息学技术领域，本申请提供的免疫肽的鉴定方法在传统鉴定特征的基础上加入保留时间偏差分值和离子定性特征分值，通过这些特征鉴定得到的免疫肽更准确。并且该方法的召回率和精确度均较高，还具有很好的F1值，说明该方法是优异的平衡召回率和精确度的免疫肽的鉴定方案。另外，肽段N端标记方法的应用显著增强了b离子的信号强度，提高了二级谱图的质量，进一步促进了免疫肽的准确识别。
免疫鉴定方法终端设备可读存储介质

[发明专利]通用性多肽疫苗及其在制备治疗/预防胰腺癌药物中的应用-CN202111665972.9在审
发明人：莫凡;周秀卿;林志伟;陈荣昌;马治明;刘慧敏 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2018-11-28 - 公布日： 2022-07-01 - 主分类号： A61K39/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种通用性多肽疫苗，包括KRAS‑G12R突变；该通用性多肽疫苗能用于制备治疗/预防癌症(胰腺癌)的药物。本发明的通用性多肽疫苗对胰腺癌具有较好的免疫治疗效果。
通用性多肽疫苗及其制备治疗预防胰腺癌药物中的应用

[发明专利]针对靶向药物阿比特龙、恩扎鲁胺、氟他胺、酮康唑聚的多肽疫苗组合及其设计方法-CN202011328459.6有效
发明人：莫凡;马治明;林志伟;韩宁;陈荣昌;周秀卿 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2019-01-29 - 公布日： 2022-06-24 - 主分类号： A61K39/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种针对靶向药物阿比特龙、恩扎鲁胺、氟他胺、酮康唑聚的多肽疫苗组合及其设计方法，设计方法包括如下步骤：收集靶向药物耐药突变数据；截取耐药突变多肽序列截取及预测MHC分子亲和力及免疫原性；靶向药物与耐药位点相互关系及药物聚类；人工设计相对应的疫苗多肽序列；通过这样的设计方法得到的靶向药物联合多肽疫苗组合能够覆盖常见的靶向治疗药物，可以有效降低肿瘤耐药发生概率，延长靶向药有效作用时间，增加患者的疾病响应率，具有广谱性，缩短个体化多肽疫苗从分析到治疗的时间，降低医疗成本。
针对靶向药物比特恩扎鲁胺酮康唑聚多肽疫苗组合及其设计方法

[发明专利]通用性多肽疫苗及其在制备治疗/预防胰腺癌药物中的应用-CN202111660405.4在审
发明人：莫凡;周秀卿;林志伟;陈荣昌;马治明;刘慧敏 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2018-11-28 - 公布日： 2022-06-03 - 主分类号： C07K14/82 文献下载
摘要：本发明公开了一种通用性多肽疫苗，包括KRAS‑G12R突变；该通用性多肽疫苗能用于制备治疗/预防癌症(胰腺癌)的药物。本发明的通用性多肽疫苗对胰腺癌具有较好的免疫治疗效果。
通用性多肽疫苗及其制备治疗预防胰腺癌药物中的应用

[发明专利]一种自组装多肽疫苗及其制备方法-CN202210114252.1在审
发明人：莫凡 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2022-01-30 - 公布日： 2022-05-13 - 主分类号： A61K39/385 文献下载
摘要：本发明公开了一种自组装多肽疫苗，包括自组装多肽分子形成的纳米胶束，纳米胶束外部复合带负电的核酸类佐剂；由核酸类佐剂桥连纳米胶束形成复合胶束纳米颗粒疫苗；所述自组装多肽分子的结构为：X‑Linker1‑Neo‑Linker2‑Y；其中，X为含疏水区域的片段，Neo为抗原片段，Y为带正电的氨基酸片段，Linker1和Linker2均为连接氨基酸片段，所述Linker1和Linker2相同或不同。本发明疫苗具有较低的细胞毒性，具有很好的结构与分散稳定性，并且功能上能够满足同时共运输多肽和多种佐剂分子的目的。
一种组装多肽疫苗及其制备方法

[发明专利]HLA II型分子与多肽的亲和力预测模型的获取方法及装置-CN202210110782.9在审
发明人：莫凡;孙英强 -专利权人： 杭州纽安津生物科技有限公司
申请日： 2022-01-29 - 公布日： 2022-05-06 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本申请实施例提供了一种HLA II型分子与多肽的亲和力预测模型的获取方法及装置，其中方法包括：获取修正训练数据集；根据修正训练数据集得到第一、第二和第三特征编码矩阵；通过初始深度学习网络模型分别对第一、第二及第三特征编码矩阵进行计算，得到HLA II型分子与肽段的组合对的第一预测亲和力值；根据第一预测亲和力值得到修正深度学习网络模型；根据修正深度学习网络模型、第一、第二和第三特征编码矩阵获取组合对的第二预测亲和力值；根据第一和第二预测亲和力值和归一化亲和力值确定修正深度学习网络模型为HLA II型分子与多肽的亲和力预测模型。这样，可提高HLA II型分子与多肽的亲和力预测模型的准确率及稳定性。
hla ii 分子多肽亲和力预测模型获取方法装置

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