本发明公开了一种粳稻抗倒伏基因的SNP功能分子标记及应用，所述抗倒伏基因为SCM2，所述SNP功能分子标记为K_06g_SCM2‑1，位于水稻第6号染色体第27481645位碱基处，该SNP分子标记多态性为T/G，其序列如SEQ ID No.1所示，第55bp位点处的碱基为T或G，位于基因SCM2启动子区域。本发明的SNP功能分子标记可用于早期（苗期或胚胎期）预测水稻粳亚种材料抗倒伏能力，可进行准确地筛选，促进了粳稻抗倒伏性状的遗传改良和育种。本发明采用KASP方法检测SNP位点，检测方法准确可靠，操作简便，适用于高通量商业化分子育种应用。
本发明公开了一种水稻稻米香味基因的SNP功能分子标记及应用，所述香味基因为badh2，基因内部的第二号外显子区域存在7bp碱基的插入缺失，所述的SNP功能分子标记为K_08g badh2‑1，位于水稻第8号染色体第20380271位碱基处，该SNP功能分子标记多态性为G/C，其序列如SEQ ID No.1。然后利用KASP方法检测SNP位点，通过不同的荧光信号，来判断水稻样品是否具有香味。本发明开发的SNP功能分子标记可用于水稻苗期或自然遗传材料高通量的筛选和鉴定，操作简便，结果准确可靠，加快了水稻香味品质性状的遗传改良和减少了育种的工作量，育种效率高，成本低。
