本发明公开了一种用于微生物发酵的启动子及其应用,该启动子包括选自下列核苷酸序列中的一种:1)如SEQ ID NO.1、2、3或4所示的核苷酸序列或其互补的核苷酸序列;2)在严格条件下与SEQ ID NO.1、2、3或4所示的核苷酸序列杂交且具有相同启动子功能的核苷酸序列;3)对SEQ ID NO.1、2、3或4所示的核苷酸序列进行一个或多个碱基的取代、缺失或添加修饰且具有相同启动子功能的核苷酸序列;4)与SEQ ID NO.1、2、3或4所示的核苷酸序列具有90%以上同源性且具有相同启动子功能的核苷酸序列。本发明的启动子用在厌氧发酵中,无需诱导物,能高效地启动其下游基因的转录及表达。