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[发明专利]一种基于因果关系的故障传播路径辨识方法-CN202310207767.0在审
发明人：吕佳鹏;秦亮;肖支才;聂新华;史贤俊 -专利权人：中国人民解放军海军航空大学
申请日： 2023-03-01 - 公布日： 2023-09-22 - 主分类号： G06F16/901 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于因果关系的故障传播路径辨识方法，属于故障传播路径辨识方法技术领域。首先需要对故障相关变量进行辨识，找到受故障影响的变量集合；其次是要对受故障影响的观测量之间的因果关系进行挖掘，辨识出变量之间的因果关系；最后以图的方式对故障的传播路径进行展现。本发明提供一种基于因果关系推断的故障传播路径辨识方法，该方法从因果关系的角度揭示故障发生及传播的内涵。
一种基于因果关系故障传播路径辨识方法

[发明专利]一种多目标测试性优化的测试集确定方法及系统-CN202310096454.2有效
发明人：秦亮;史贤俊;聂新华;肖支才;吕佳朋 -专利权人：中国人民解放军海军航空大学
申请日： 2023-02-10 - 公布日： 2023-08-11 - 主分类号： G06F11/36 文献下载
摘要：本发明的目的是提供一种多目标测试性优化的测试集确定方法及系统，特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法技术领域，根据测试集和故障‑测试相关矩阵，确定优化测试集，进而确定测试资源种类和测试属性种类；根据优化测试集中的测试、测试资源种类和测试属性种类构建三维矩阵；分别构建每种测试属性对应的矩阵优化函数，得到矩阵优化函数组；构建决定矩阵；根据三维矩阵求解矩阵优化函数组，确定最优决定矩阵；根据最优决定矩阵进行测试性优化。通过将多种测试属性作为优化目标确定测试集，提高了测试性优化的合理性。将多种测试属性作为优化目标确定最优决定矩阵用于测试性优化，提高了测试性优化的合理性。
一种多目标测试优化确定方法系统

[发明专利]一种筛选与研究目的相关的关键基因、关键蛋白集的方法-CN202011320196.4有效
发明人：公光业;肖云平;唐旋;栗鹏;王树伟;史贤俊;林博;刘钰钏 -专利权人：上海欧易生物医学科技有限公司
申请日： 2020-11-23 - 公布日： 2023-06-16 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种筛选与研究目的相关的关键基因、关键蛋白集的方法，包括以下步骤：对不同组学数据内容，以差异基因/蛋白或差异基因/蛋白并集为总目标集，筛选出与研究相关的指标，根据所述指标的生物学意义进行赋值；使用一套支持自定义修改和权重设置的打分机制，对总目标集的各个指标进行综合打分；对综合打分的topN基因/蛋白，进行表达和功能上的复现和展示，根据结果返回验证筛选的准确性。本发明不仅可以通过筛选出的top目标集的表达和功能复现实现自我验证和自我完善，也可以通过目标筛选数据集的积累形成字典不断丰富和完善，从而使得整套方法更趋准确和可靠。
一种筛选研究目的相关关键基因蛋白方法

[发明专利]基于递推规范变量残差和核主元分析的微小故障检测方法-CN202210737859.5有效
发明人： 史贤俊;秦玉峰;秦亮;聂新华;王朕 -专利权人：中国人民解放军海军航空大学
申请日： 2022-06-27 - 公布日： 2023-06-06 - 主分类号： G05B23/02 文献下载
摘要：本发明涉及故障诊断技术领域，尤其涉及一种基于递推规范变量残差和核主元分析的微小故障检测方法，首先构造规范变量残差,从中提取数据的线性特征，利用指数加权滑动平均法对规范变量残差进行递推滤波处理,提高规范变量残差对微小故障的敏感程度，然后使用KPCA提取规范变量残差中的非线性主成分作为非线性特征,根据提取的特征提出了两个新的故障检测统计量；此外,利用核密度估计确定故障检测统计量的控制限。由于同时提取了过程数据的线性和非线性特征,有效地提高了非线性动态过程中微小故障的可检测性。
基于规范变量核主元分析微小故障检测方法

[发明专利]一种分级测试性优化的测试集确定方法及系统-CN202210746802.1有效
发明人：秦亮;史贤俊;聂新华;肖支才;吕佳朋;王朕 -专利权人：中国人民解放军海军航空大学
申请日： 2022-06-28 - 公布日： 2023-05-12 - 主分类号： G01M99/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种分级测试性优化的测试集确定方法及系统，涉及计算机辅助设计技术领域，对设备进行测试性建模，得到设备测试性模型；基于设备测试性模型对设备进行测试性分析，得到初始故障‑测试相关矩阵；对初始故障‑测试相关矩阵进行机内测试级优化，得到机内故障‑测试相关矩阵；对初始故障‑测试相关矩阵进行自动测试级优化，得到自动故障‑测试相关矩阵；对初始故障‑测试相关矩阵进行人工测试级优化，得到人工故障‑测试相关矩阵，进而确定测试集和故障集；本发明通过对初始故障‑测试相关矩阵进行机内测试级优化、自动测试级优化和人工测试级优化，对不同测试分别构建测试集和故障集，进而提高测试性优化能力。
一种分级测试优化确定方法系统

[发明专利]基于参考基因组注释文件的高通量测序技术动物tRFs数据分析方法-CN202010057500.4有效
发明人：徐天生;肖云平;王树伟;史贤俊;林博;刘钰钏 -专利权人：上海欧易生物医学科技有限公司
申请日： 2020-01-19 - 公布日： 2023-02-10 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明提出了一种基于参考基因组注释文件的高通量测序技术动物tRFs数据分析方法，包括文件准备步骤、tRNA数据库整理步骤、GO、KEGG背景文件整理步骤、下机数据质控步骤、参考基因组比对步骤、tRFs比对注释步骤、差异tRFs分析步骤、靶基因预测及富集分析步骤、网页版报告整理步骤。本发明结果全面，包含涉及到的tRFs分析内容以及其靶基因预测，GO、KEGG富集分析以及对应的可视化展示；自动整理所有分析结果，每一步分析完成之后自动对结果进行汇总统计，可视化，以及逻辑化归类整理，结果文件可直接用于生成网页版报告；所有操作步骤可以溯源，方便错误查询，如果分析报错，会有对应的报错日志信息。
基于参考基因组注释文件通量技术动物 trfs 数据分析方法

[发明专利]一种基于最大均值差异的故障可诊断性定量评价方法-CN202210733276.5在审
发明人： 史贤俊;秦亮;秦玉峰;王朕;聂新华 -专利权人：中国人民解放军海军航空大学
申请日： 2022-06-27 - 公布日： 2022-12-20 - 主分类号： G06F11/07 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于最大均值差异的故障可诊断性定量评价方法，尤其涉及故障可诊断性技术领域，方法包括：系统根据不同故障模式下测量信息相似性大小来判断故障可诊断性强弱；所述系统设为独立同分布随机变量样本，且满足X～P，Y～Q，P，Q为未知多元分布，对于一些复杂高维随机变量，用随机变量的矩对其进行描述；所述系统基于最大均值差异的思想计算随机变量的任意阶矩；实现了不需要建立系统模型可对系统中的故障可诊断性进行评价，用于结构复杂不易于建模，获取测量数据的复杂系统；评价结果满足距离定义中的对称性，结果更有实际意义；不要求分布必须存在重叠部分，适用范围更广且结果更加准确。
一种基于最大均值差异故障诊断定量评价方法

[发明专利]一种装备测试性验证故障样本量确定方法及系统-CN202010649567.7有效
发明人：秦亮;王康;史贤俊;聂新华;王朕;陆巍巍;肖支才;张文广 -专利权人：中国人民解放军海军航空大学
申请日： 2020-07-08 - 公布日： 2022-11-22 - 主分类号： G06K9/62 文献下载
摘要：本发明公开了一种装备测试性验证故障样本量确定方法及系统。该系统包括：根据装备的功能结构，构建测试性验证模型；所述测试性验证模型包括多个层次节点；所述测试性验证模型为层次贝叶斯网络模型；计算所述测试性验证模型的故障检测率的后验概率分布；根据所述后验概率分布计算承制方风险值以及使用方风险值；根据承制方风险值以及使用方风险值，计算故障样本量以及故障判据；根据所述故障样本量以及所述故障判据，对所述故障样本量进行分配；根据分配情况对所述故障样本量进行限制，得到最终故障样本量。本发明能够保证样本量的充分性和合理性。
一种装备测试验证故障样本确定方法系统

[发明专利]一种基于装备使用期间的测试性指标评估方法及系统-CN202010689763.7有效
发明人：秦亮;王康;史贤俊;王朕;吕佳朋;秦玉峰;翟禹尧 -专利权人：中国人民解放军海军航空大学
申请日： 2020-07-17 - 公布日： 2022-11-22 - 主分类号： G06F17/18 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于装备使用期间的测试性指标评估方法及系统，该方法包括：获取装备的先验数据集合；采用贝叶斯方法对所述先验数据集合中的成败数据、点估计型数据和区间估计型数据分别进行转化，得到贝叶斯先验数据集合；根据所述先验数据集合确定数据权重集合；获取装备当前时刻的当前使用数据；所述当前使用数据包括当前时刻的故障样本量及当前时刻的故障检测率和故障隔离率失败的次数；根据所述贝叶斯先验数据集合、所述数据权重集合和所述当前使用数据确定装备当前时刻的测试性指标评估值。通过本发明的上述方法以解决现有技术中数据量大、周期长且准确度不高的问题。
一种基于装备使用期间测试指标评估方法系统

[发明专利]基于高通量测序技术的宿主中病毒来源sRNA数据分析方法-CN202110354949.1有效
发明人：肖云平;徐天生;杨雨晴;刘钰钏;史贤俊;林博 -专利权人：上海欧易生物医学科技有限公司
申请日： 2021-04-01 - 公布日： 2022-08-26 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明提出了一种基于高通量测序技术的宿主中病毒来源sRNA数据分析方法，包括文件准备步骤、下机数据质控步骤、病毒参考基因组比对以及病毒sRNA注释步骤、病毒sRNA定量步骤、差异病毒sRNA分析步骤、宿主靶基因预测步骤、富集分析步骤、网页版报告整理步骤。本发明结果全面，包含涉及到的病毒sRNA分析内容以及其宿主靶基因预测，GO、KEGG富集分析以及对应的可视化展示；自动整理所有分析结果，每一步分析完成之后自动对结果进行汇总统计、可视化以及逻辑化归类整理，结果文件可直接用于生成网页版报告，所有操作步骤可以溯源，方便错误查询，如果分析有报错，会生成对应的报错日志信息。
基于通量技术宿主病毒来源 srna 数据分析方法

[发明专利]基于python的二代测序样本混样方法、应用、设备、计算机可读存储介质-CN202011383260.3有效
发明人：蔡志强;闵运丰;李晖;徐天生;吴学标;肖云平;史贤俊 -专利权人：上海欧易生物医学科技有限公司
申请日： 2020-12-01 - 公布日： 2022-08-23 - 主分类号： G06F8/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于python的二代测序样本混样方法，包括以下步骤：文件读取并解析，样品排序到流通槽，样品添加接头序列，计算样本混样体积，输出混样表格。本发明方法可以自动检测每个流通槽是否含有接头重复，计算流通槽中最优组合的样本，并自动计算最优混样体积，输出结果清晰明了，提高生产中样本混样的效率和精确性。本发明还公开了一种上述方法在二代测序混样中的应用。
基于 python 二代样本方法应用设备计算机可读存储介质

[发明专利]一种基于snakemake流程的正选择基因的检测方法和系统-CN202110223562.2有效
发明人：安冬;肖云平;史贤俊;林博;刘钰钏;顾胤聪;鲍志贵;范旭蕾 -专利权人：上海欧易生物医学科技有限公司
申请日： 2021-03-01 - 公布日： 2022-08-23 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于snakemake流程的正选择基因的检测方法，能够高效快速鉴定目标物种受正选择基因，为解析物种环境适应性的分子机制、物种演化提供分子依据。本发明还公开了一种实现上述方法的检测系统，所述检测系统具体包括：序列提取模块、基因家族聚类模块、多序列比对模块、基因树构建模块、基因树标记模块、正选择筛选模块。本发明基于snakemake流程的正选择基因的检测方法和检测系统可以高效鉴定目标物种在进化过程中受正选择的基因，对于研究物种对环境适应等演化机制的研究有重要意义。本发明还提出了一种基于snakemake流程的正选择基因的检测系统。
一种基于 snakemake 流程选择基因检测方法系统

[发明专利]基于snakemake语言快速批量可自动邮件反馈结果的高通量测序质控分析方法-CN202110338467.7有效
发明人：张建明;顾胤聪;肖云平;史贤俊;刘钰钏;林博 -专利权人：上海欧易生物医学科技有限公司
申请日： 2021-03-30 - 公布日： 2022-07-26 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于snakemake语言快速批量可自动邮件反馈结果的高通量测序质控分析方法，所述方法具体包括如下步骤：文件准备；多样本并行fastp质控过滤；单样本fastp运行监控；所有样本fastp质控结果汇总；质控结果汇总邮件反馈；多样本并行fastqc检测；所有样本结果进行整合；分析方法图绘制。本发明所述分析方法能够对样本进行批量处理，获得的结果全面，并能够自动整理所有分析结果，进行统计汇总可视化，同时所有操作步骤可溯源，方便错误查询。
基于 snakemake 语言快速批量自动邮件反馈结果通量测序质控分析方法

[发明专利]一种乳腺癌临床穿刺样本的解离方法-CN201911281650.7有效
发明人：洪强;王树伟;肖云平;史贤俊;赵仕兰 -专利权人：上海欧易生物医学科技有限公司
申请日： 2019-12-13 - 公布日： 2022-07-26 - 主分类号： C12N5/09 文献下载
摘要：本发明公开了一种乳腺癌临床穿刺样本解离的方法，包括样本处理、自然沉降弃上清、离心洗涤、酶解、过筛、裂红洗涤、PBS+10％FBS重悬等步骤。本发明使用自主研发的酶解方案提升了乳腺癌临床穿刺样本的细胞得率，缩短了酶解的时间，提高了细胞的得率。本发明还公开了一种用于乳腺癌临床穿刺样本解离的组织解离液。
一种乳腺癌临床穿刺样本解离方法

[发明专利]测试点设置方案生成方法及装置-CN202010182333.6有效
发明人：秦玉峰;史贤俊;秦亮;聂新华;翟禹尧;吕佳朋 -专利权人：中国人民解放军海军航空大学
申请日： 2020-03-16 - 公布日： 2022-05-31 - 主分类号： F42B35/02 文献下载
摘要：本发明实施例提供一种测试点设置方案生成方法及装置，该方法包括：根据每一故障点是否设置测试点，确定多个测试方案；根据各测试方案的故障测试相关性矩阵，确定对应的故障检测率和故障隔离率；选取总测试点数最少或小于预设点数，且故障检测率和故障隔离率分别大于对应预设阈值的测试方案；其中，所述故障测试相关性矩阵，根据测试方案构建的对角矩阵和故障传播矩阵的乘积得到；所述故障传播矩阵中的元素，表示对应序号的故障之间是否有传播关系。该方法无需凭借人工经验获得，具有客观性，保证测试效果的同时，测试点最少，有效减少测试性设计的工作量。此外，有利于测试方案的自动生成，且同时保证测试方案的有效性和客观性。
测试设置方案生成方法装置

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