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[发明专利]用于编辑目标核酸的组合物及编辑目标核酸的方法-CN202210387369.7在审
发明人：仇宗浩;侯强波;杜雅冉;朱佳凤;周晨;孙振华 -专利权人：苏州科锐迈德生物医药科技有限公司
申请日： 2022-04-13 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本公开涉及用于编辑目标核酸的组合物及编辑目标核酸的方法，具体涉及一种用于编辑目标核酸的组合物、试剂盒及用途，编辑目标核酸的方法，预防或治疗疾病的方法。本公开提供的用于编辑目标核酸的组合物，利用环状mRNA以及环状或线状的gRNA向细胞内递送编码目标核酸的CRISPR相关蛋白以及gRNA分子，避免了以质粒、病毒等作为载体递送CRISPR相关蛋白、gRNA时存在的向细胞基因组内整合的安全隐患，具有使用安全性高、基因编辑效率高的优势，在基因编辑、疾病治疗等生物医学领域具有广阔的应用前景。
用于编辑目标核酸组合方法

[发明专利]基于莱文斯坦距离筛选IRES的方法及其筛选的多核苷酸-CN202111435528.8在审
发明人： 侯强波;朱佳凤;仇宗浩;左炽健;孙振华 -专利权人：苏州科锐迈德生物医药科技有限公司
申请日： 2021-11-29 - 公布日： 2023-04-14 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本公开属于生物信息学和生物工程技术领域，具体涉及一种基于莱文斯坦距离筛选IRES的方法，基于该方法筛选得到的多核苷酸，包含多核苷酸的环状核酸分子、环化前体核酸分子、重组核酸分子、重组表达载体、重组宿主细胞及用途。本公开通过比较所有样本序列与待预测序列的莱文斯坦距离的均值，可高效准确地判断待预测序列中是否存在IRES，具有效率高、筛选结果准确的优势；且通过本公开提供的IRES预测方法筛选到的IRES活性高，为环状核酸分子在制备蛋白、作为疫苗、生产治疗性蛋白或作为基因治疗手段等方面的应用提供了丰富的翻译起始元件。
基于斯坦距离筛选 ires 方法及其多核苷酸

[发明专利]一种预测抗体重链轻链配对概率的方法及其应用-CN201910730394.9有效
发明人：吴婷婷;侯强波;蔡晓辉;杨平 -专利权人：苏州泓迅生物科技股份有限公司
申请日： 2019-08-08 - 公布日： 2023-03-21 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明涉及一种预测抗体重链轻链配对概率的方法，所述方法基于卷积神经网络对抗体重链轻链配对概率进行预测，具体而言，将已知配对信息的抗体样本重链、轻链的氨基酸序列特征转换为数字信号后，输入卷积神经网络中进行训练，获得最终的模型参数，再利用该模型参数对待预测的抗体重链轻链的配对概率进行预测。该方法通过机器学习即可获取抗体的配对信息概率，操作简便、快速、高效、成本较低、重复性高、准确率高，准确率可达67.4％，且可以实现数目较多的抗体重链、轻链配对，其对临床研究、抗体发现、抗体库等研究具有重要的意义。
一种预测抗体重链轻链配对概率方法及其应用

[发明专利]基于翻译起始元件点突变的重组核酸分子及其在制备环状RNA中的应用-CN202210200186.X在审
发明人： 侯强波;仇宗浩;赵阳;左炽健;孙振华 -专利权人：苏州科锐迈德生物医药科技有限公司
申请日： 2022-03-02 - 公布日： 2022-06-03 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本公开涉及基于翻译起始元件点突变的重组核酸分子及其在制备环状RNA中的应用，具体涉及用于制备环状RNA的重组核酸分子、重组表达载体、环状RNA、组合物、制备环状RNA的方法、在细胞内表达目标多肽的方法、预防或治疗疾病的方法，编辑翻译起始元件序列的方法，以及用于编辑翻译起始元件序列的系统。本公开提供的重组核酸分子，为环状RNA的体外制备提供了一种结构新颖的Clean PIE系统，能够避免在环状RNA中引入额外的外显子序列，提高环状RNA分子的序列精确度，减小环状RNA的二级结构的改变，进而降低环状RNA的免疫原性，在核酸疫苗、表达治疗性蛋白、基因治疗等领域具有良好的应用前景。
基于翻译起始元件突变重组核酸分子及其制备环状 rna 中的应用

[发明专利]一种重组核酸分子及其在制备环状RNA中的应用-CN202210200112.6在审
发明人：仇宗浩;侯强波;赵阳;左炽健;孙振华 -专利权人：苏州科锐迈德生物医药科技有限公司
申请日： 2022-03-02 - 公布日： 2022-05-06 - 主分类号： C12N15/85 文献下载
摘要：本公开涉及一种重组核酸分子及其在制备环状RNA中的应用，具体涉及用于制备环状RNA的重组核酸分子、重组表达载体、环状RNA、组合物、制备环状RNA的方法、在细胞内表达目标多肽的方法，筛选目标编码区序列的方法、用于筛选目标编码区序列的系统，以及筛选核酶识别位点序列的方法。本公开提供的重组核酸分子，为环状RNA的体外制备提供了一种结构新颖的Clean PIE系统，能够避免在环状RNA中引入额外的外显子序列，提高环状RNA分子的序列精确度，减小环状RNA的二级结构的改变，进而降低环状RNA的免疫原性，在核酸疫苗、表达治疗性蛋白、基因治疗等领域具有良好的应用前景。
一种重组核酸分子及其制备环状 rna 中的应用

[发明专利]基于动态规划的抗体人源化的方法与装置-CN202110576067.X在审
发明人： 侯强波;左炽健;孙振华 -专利权人：江苏普瑞康生物医药科技有限公司
申请日： 2021-05-26 - 公布日： 2021-09-14 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本公开提供了基于动态规划的抗体人源化的方法与装置，该方法包括：获取人类抗体基因序列；对异源抗体基因序列进行编号；基于动态规则算法，将异源抗体基因序列与人类抗体基因序列进行比对；根据比对结果，进行氨基酸替换，得到人源化后的抗体基因序列。本公开的基于动态规划的抗体人源化的方法与装置，通过动态规划进行异源抗体表面氨基酸残基的人源化改造，减小抗体异源性，人源化速度快，可批量进行序列的人源化，人源化后的抗体序列亲和力和特异性好。
基于动态规划抗体人源化方法装置

[发明专利]一种图像存储方法、读取方法、存储装置和读取装置-CN201910503132.9有效
发明人：吴婷婷;侯强波;蔡晓辉;杨平 -专利权人：苏州泓迅生物科技股份有限公司
申请日： 2019-06-11 - 公布日： 2021-09-03 - 主分类号： H04N19/423 文献下载
摘要：本公开涉及信息处理技术领域，尤其涉及一种图像存储方法、读取方法、存储装置和读取装置。包括：对原始图像进行小波变换，得到多级子图像对应的小波变换系数；获取级别大于或等于预设值的子图像对应的目标小波变换系数；根据DNA碱基序列与小波变换系数的预设对应关系，将所述目标小波变换系数编码成DNA序列。本公开根据子图像级别和类型对图像重构的重要性以及子图像本身的数据量，选取符合要求的子图像对应的目标小波变换系数进行DNA编码，能够有效的压缩编码的数据量，且能保证高清解码，实现图像数据的高效存储。
一种图像存储方法读取装置

[发明专利]一种基于分治法的mRNA序列优化的方法与装置-CN202110039347.7在审
发明人：孙振华;侯强波;左炽健;董世英 -专利权人：江苏普瑞康生物医药科技有限公司
申请日： 2021-01-18 - 公布日： 2021-04-30 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本申请涉及一种基于分治法的mRNA序列优化的方法和装置，采用分治法对mRNA序列优化，通过在每次合并后均检查是否有发夹结构生成以及是否具有影响蛋白表达的因素，能够保证优化的mRNA序列不具有上述影响表达的因素，生成序列结构稳定，优化序列表达效率高。同时采用的分治法具有优化速度快，可进行批量序列优化的特点。
一种基于分治 mrna 序列优化方法装置

[发明专利]一种重组基因工程菌及其发酵产香兰素的应用-CN201910372305.8有效
发明人：嘉晓勤;刘昌东;侯强波;郑王建;燕化远;陈小龙 -专利权人：浙江工业大学
申请日： 2019-05-06 - 公布日： 2021-04-06 - 主分类号： C12N1/21 文献下载
摘要：本发明公开了一种重组基因工程菌及其发酵产香兰素的应用，所述重组基因工程菌是由耐受香兰素或阿魏酸的基因导入宿主菌构建而成，所述耐受香兰素或阿魏酸的基因包括周质膜融合蛋白AcrA基因、内膜转运蛋白AcrB基因或外膜蛋白TolC基因中的一种或多种；所述宿主包括含ech基因和fcs基因的大肠杆菌。本发明所述重组基因工程菌E.coli BW25113::PegYB::pACYCDuet‑acrAB‑tolC可利用阿魏酸为底物生产香兰素，香兰素最高产量为2335mg/L。采用本发明的方法发酵产生的发酵液中含有更高的香兰素，具有很好的应用前景。
一种重组基因工程及其发酵产香兰素应用

[发明专利]一种图像编码方法、解码方法、编码装置和解码装置-CN201910189403.8有效
发明人：吴婷婷;侯强波;蔡晓辉;杨平 -专利权人：苏州泓迅生物科技股份有限公司
申请日： 2019-03-13 - 公布日： 2020-09-22 - 主分类号： H04N19/60 文献下载
摘要：本公开涉及一种图像编码方法、解码方法、编码装置和解码装置。包括：通过小波变换函数，对原始图像进行一级或多级分解，得到多个子图像的像素数据对应的小波变换系数以及所述子图像的级别；根据所述小波变换系数以及所述小波变换系数对应的子图像的级别，确定所述小波变换系数的有效数值；根据DNA碱基序列与数字的对应关系以及所述有效数值，确定所述小波变换系数的编码DNA序列；根据所述子图像的级别，连接所述小波变换系数的编码DNA序列，确定所述原始图像的编码DNA序列。本公开图像压缩率高，且所述数字表示可以包括二进制以上的进制数，可减少四种基本碱基连续出现的概率，从而降低DNA合成难度。
一种图像编码方法解码装置

[发明专利]一种信息存储介质、信息存储方法及应用-CN202010443536.6在审
发明人：朱佑民;程倩;王梓旭;陶小倩;侯强波;杨平;柳伟强;邢妍婧;赵一凡 -专利权人：苏州泓迅生物科技股份有限公司
申请日： 2020-05-22 - 公布日： 2020-07-24 - 主分类号： C12N15/90 文献下载
摘要：本发明提供了一种信息存储介质、信息存储方法及应用，所述信息存储介质为核酸分子；所述信息存储介质包括由存储信息对应的密码子序列和荧光蛋白基因构成的融合基因。本发明利用氨基酸对应的密码子进行信息存储，存储的信息不仅可以利用测序技术进行读取，而且可以根据蛋白质对应的氨基酸序列推测其所包含的信息，即使DNA被损坏，也不影响信息的读取；而且，存储的密码子序列理论上可以翻译成荧光蛋白质，通过激光共聚焦显微镜观察荧光颜色进行信息分类。
一种信息存储介质方法应用

[发明专利]一种图像重构方法及装置-CN201910561039.3在审
发明人：吴婷婷;侯强波;蔡晓辉;杨平 -专利权人：苏州泓迅生物科技股份有限公司
申请日： 2019-06-26 - 公布日： 2019-09-27 - 主分类号： G16H30/20 文献下载
摘要：本公开涉及一种图像重构方法及装置。包括：获取利用DNA存储的压缩图像对应的DNA碱基序列，所述DNA碱基序列中包括多个DNA碱基和/或碱基组合；根据DNA碱基和/或碱基组合与解压值的对应关系，将所述DNA碱基序列解压成第一图像数据；将所述第一图像数据输入至图像重构模型，经所述图像重构模型输出第二图像数据。本公开对所述第一图像数据重构出具有更高像素密度、更细腻的画质和更多细节的第二图像，从而满足较高画面质量的需求，为DNA图像存储的广泛应用提供了有力的技术保障。
图像重构碱基组合图像数据解压图像数据输入图像数据重构技术保障图像存储压缩图像应用提供高像素画质图像输出

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