[发明专利]对样品成像用于生物或化学分析的方法、载体组件和系统在审

专利信息
申请号: 202011181966.1 申请日: 2016-03-22
公开(公告)号: CN112326557A 公开(公告)日: 2021-02-05
发明(设计)人: 史蒂芬·罗林斯;文卡特施·迈索尔·纳加拉贾拉奥;洪明强;尼廷·阿德帕 申请(专利权)人: 伊鲁米那股份有限公司;伊鲁米纳剑桥有限公司
主分类号: G01N21/13 分类号: G01N21/13;G01N21/25;G01N21/64;G01N35/04;G01N35/10;B01L3/00;B01L7/00;B01L9/00;C12Q1/6837;C12Q1/6869;G02B21/34
代理公司: 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 代理人: 孙静;郑霞
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 样品 成像 用于 生物 化学分析 方法 载体 组件 系统
【说明书】:

本申请涉及对样品成像用于生物或化学分析的方法、载体组件和系统。方法包括将第一载体组件定位在系统台上。第一载体组件包括支撑框架,其具有限定支撑框架的窗口的内框架边缘。第一载体组件包括位于窗口内并被内框架边缘包围的第一基底。第一基底具有在其上的样品。该方法包括检测来自第一基底的样品的光信号。该方法还包括用系统台上的第二载体组件替换系统台上的第一载体组件。第二载体组件包括支撑框架和由支撑框架保持的接装板。第二载体组件具有由接装板保持的第二基底,第二基底具有在其上的样品。该方法还包括检测来自第二基底的样品的光信号。

本申请是申请日为2016年3月22日,申请号为201680024922.3,发明名称为“用于对样品成像用于生物或化学分析的方法、载体组件和系统”的申请的分案申请。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2015年3月24日提交的美国临时专利申请第62/137,600号的利益,其通过引用以其整体并入本文。

发明背景

本发明的实施方式大体上涉及生物或化学分析,且更特别地涉及用于检测来自样品的光信号以用于生物或化学分析的方法、载体组件和系统。

用于生物或化学研究的各种测定方案涉及进行大量受控反应。在一些情况下,受控反应在支撑表面上进行。然后可以观察和分析指定的反应,以帮助识别指定反应中所涉及的化学物质的性质或特性。例如,在一些方案中,包括可识别标记(例如荧光标记)的化学组成部分可以在受控条件下选择性地结合到另一化学组成部分。可以通过用辐射激发标记并检测来自标记的光发射来观察这些化学反应。

这些方案的示例包括DNA测序和基于多重阵列的测定。在一个边合成边测序(SBS)方案中,克隆扩增子的簇通过桥式PCR在流动池的通道的表面上形成。在生成克隆扩增子的簇之后,扩增子可以被“线性化”以制造单链DNA(sstDNA)。试剂的预定序列可以流入流动池内以完成测序周期。每个测序周期将sstDNA延长具有独特荧光标记的单个核苷酸(例如A、T、G、C)。每个核苷酸都具有允许在一个周期中仅出现单碱基掺入的可逆终止子。在将核苷酸添加到sstDNA簇后,获取在四个通道中的图像(即,针对每个荧光标记有一个通道)。在成像后,荧光标记和终止子从sstDNA化学地分开,且生长的DNA链为另一周期作准备。可以重复试剂输送和光学检测的几个周期以确定克隆扩增子的核酸的序列。

在一些基于多重阵列的测定方案中,将不同探针分子的群体固定到基底表面。可以基于每个探针在基底表面上的地址来区分探针。例如,探针分子的每个群体可以具有在基底表面上的已知位置(例如,网格上的坐标)。探针分子在受控条件下暴露于目标分析物,使得由于在目标分析物和探针之间的特定相互作用,可检测的变化在一个或更多个地址处出现。例如,可以基于荧光标记到探针的地址的聚集来识别与特定探针结合的荧光标记的目标分析物。阵列上的地址可以由测定系统确定,以识别哪些群体与分析物反应。通过知道与分析物反应的探针分子的化学结构,可以确定分析物的性质。在其他多重测定中,指定的反应在可以被扫描和分析的单独可识别的微粒的表面上进行。

不同的测定方案(诸如上面描述的那些)可以包括特定特征或涉及特定步骤,其在其他测定方案中不发生。例如,不同的测定方案可以使用不同类型的试剂或具有独特修饰性试剂、具有不同发射光谱的标记、用于支持样品的不同类型的光学基底(例如,流动池、开放面基底、微阵列、井(well)、微粒)、具有不同激发光谱的不同光源、不同的光学部件(例如物镜)、热条件和软件。此外,由于检测发生在几微米或更小的分辨率下,因此设备通常在高精度水平下操作。作为结果,现今存在的平台通常涉及执行仅仅一种类型的测定方案。

因此,存在对于能够进行多于一种类型的测定方案的测定系统和相应的部件的需要。

发明简述

本公开提供了以下内容:

1.一种方法,包括:

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