[发明专利]一种用于检测转移性去势抵抗性前列腺癌的基因探针组合物及试剂盒

说明书

一种用于检测转移性去势抵抗性前列腺癌的基因探针组合物，由ATM基因探针、ATR基因探针、AR基因探针、BARD1基因探针、BRCA1基因探针、BRCA2基因探针、BRIP1基因探针、CDH1基因探针、CDK12基因探针、CHEK2基因探针、EPCAM基因探针、ERCC2基因探针、ERCC3基因探针、ERCC4基因探针等五十个基因探针组成。本发明还提供了一种用于检测转移性去势抵抗性前列腺癌的试剂盒，含有上述的基因探针组合物。本发明通过探针设计，可以一次检测多种胚系突变和多种体细胞突变类型，包括SNV、Indel、CNV、基因融合等，全面解读分析与药物相关的靶点基因，为临床治疗决策提供参考信。

技术领域

本发明属于生物工程领域，涉及一种基因探针及试剂盒，具体来说是一种用于检测转移性去势抵抗性前列腺癌的基因探针组合物及试剂盒。

背景技术

NGS技术：高通量测序技术一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，高通量(Next Generation Sequencing，NGS)又名下一代测序技术，足见其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(Deep Sequencing)。Illumina平台是现在主流的二代测序平台，市场占有率在90％以上。

与早期基因检测技术对比：荧光原位杂交(FISH)虽不失高灵敏度但操作难度较大；传统聚合酶链式反应(PCR)在操作简便性和快速性上颇具优势，但是技术原理限制了其只能检测一个或几个基因；基因芯片技术虽然可以检测大量基因，但只能检测已知基因，假阳性率高，准确性不足；NGS则具有通量高、准确度高、成本可接受的优点，既可以一次性检测大量基因(包括已知和未知基因)，准确率又高于基因芯片，同时测序成本又相对不高。从长远来看，随着测序成本的持续下降和测序流程的逐步优化，基因测序对基因芯片等其他基因检测技术的替代将成为大势所趋；但当前各技术分支根据不同的临床需求和自身优势仍具有特定的细分市场。

目标序列捕获测序：目标序列捕获测序是将感兴趣的基因组区域通过捕获试剂盒进行富集后再进行测序的研究策略，根据不同的应用，利用较少的数据量就可以得到超高的灵敏度和准确度，可以快速筛选到变异位点。现在主流的靶向技术，主要是基于多重PCR技术或者探针杂交捕获技术。

液态活检：液态活检(Liquid Biopsy)与传统的组织活检相比有着迅速、便捷、损伤性小等众多优点。临床医生可以用它来监测肿瘤对治疗的反应，预测肿瘤复发。从长远角度来看，液态活检还能够帮助医生在患者未出现任何症状的时候发现最初期的肿瘤。从血液中游离的DNA片段中取得的基因组信息甚至可以指出体内肿瘤发源的部位。

近年肿瘤的液态活检技术受到产业和资本的重视，该技术是在外周血中寻找脱落或凋亡释放的循环肿瘤DNA(ctDNA)或循环肿瘤细胞(CTC)或外泌体(exosome)进行基因测序，目标是开发一种“泛癌症”的筛查诊断技术。

与传统的肿瘤组织取样相比，液态活检技术的主要优点包括：无创取样(血液检测)、克服肿瘤异质性(反映患者肿瘤细胞整体的基因变异信息)、实时监测分析(如ctDNA的浓度与肿瘤的进展高度相关)；该技术可以实现的重要功能包括：肿瘤早诊、辅助分期、预后评估、复发监测、用药指导等。液态活检技术其实并不算新贵，其与NIPT原理一样是基于检测外周血中游离的cfDNA(如孕妇外周血中游离的胎儿DNA、个体血液中游离的ctDNA)，或者检测外周血中游离的胎儿细胞/肿瘤细胞CTC。该项技术同样是建立在NGS技术突破的基础之上，可以实现对痕量DNA进行高精确度、高灵敏度的检测，从而达到相应的检测目的。