[发明专利]利用外切酶组合消除三维基因组学技术噪音的方法及应用在审
申请号: | 201810589904.0 | 申请日: | 2018-06-08 |
公开(公告)号: | CN108804872A | 公开(公告)日: | 2018-11-13 |
发明(设计)人: | 张玉波;孔思远;张高林;黄其通;范磊;李清;黄雷;彭艳玲 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院农业基因组研究所 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18;G06F19/20 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 518120 广东省深圳市大鹏*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 外切酶 基因组学 技术噪音 三维 线性DNA 组合酶 测序 邻近 关键步骤 技术连接 生物信息 无效信息 有效手段 环状DNA 大数据 假阳性 应用 噪音 终端 节约 表现 | ||
1.一种利用外切酶组合消除三维基因组学技术噪音的方法,其特征在于,在三维基因组学技术的关键步骤邻近连接时加入外切酶组合消除邻近连接后线性DNA,提高环状有效互作比例。
2.根据权利要求1所述利用外切酶组合消除三维基因组学技术噪音的方法,其特征在于,所述外切酶组合包括两个外切酶Lambda和RecJF。
3.根据权利要求2所述利用外切酶组合消除三维基因组学技术噪音的方法,其特征在于,所述外切酶组合还包括配合两个外切酶Lambda和RecJF使用的Lambda Buffer或者CutSmart Buffer。
4.根据权利要求1所述利用外切酶组合消除三维基因组学技术噪音的方法,其特征在于,所述三维基因组学技术为以3C-邻近连接为基础发展而来的三维基因组学技术。
5.根据权利要求4所述利用外切酶组合消除三维基因组学技术噪音的方法,其特征在于,所述三维基因组学技术包括3C、4C、5C、ChIA-PET和Hi-C技术。
6.如权利要求1-5任一项所述的利用外切酶组合消除三维基因组学技术噪音方法的应用,其特征在于,利用外切酶组合在三维基因组学技术关键步骤邻近连接中噪音的消除应用。
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