[发明专利]动脉粥样硬化的识别模型的构建方法有效

专利信息
申请号: 201810010227.2 申请日: 2018-01-05
公开(公告)号: CN110111841B 公开(公告)日: 2023-03-10
发明(设计)人: 陈兴栋;朱嗣博;庆涛;金力 申请(专利权)人: 复旦大学泰州健康科学研究院
主分类号: G16B25/00 分类号: G16B25/00;G16B5/00;C12Q1/6806;C12Q1/6869;C12Q1/6883
代理公司: 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 代理人: 张柳;赵青朵
地址: 225300 江苏省*** 国省代码: 江苏;32
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 动脉粥样硬化 识别 模型 构建 方法
【权利要求书】:

1.动脉粥样硬化的识别模型的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:

步骤1:获得待测样本的宏基因组DNA;

步骤2:建库、测序,获得宏基因组数据;

所述建库包括DNA碎片化反应;

所述DNA碎片化反应的体系包括Tagment DNA buffer(2x)、Amplicon tagment mix(Tn5)、宏基因组DNA和水;

所述建库还包括宏基因组DNA扩增;

所述宏基因组DNA扩增的反应体系包括所述DNA碎片化反应的产物、NPM、i7 lluminaindex preimer和i5 illumina index primer;

所述宏基因组DNA扩增的反应程序包括:72℃反应3min,95℃反应30s,16次循环(95℃反应10s+55℃反应30s+72℃反应30s),72℃反应5min,10℃终止反应;

所述测序采用Nextera转座子鸟枪宏基因组测序和高通量16s V3-V4rDNA测序

步骤3:所述宏基因组数据经分析,并经训练集和验证集矫正,再经机器学习,结合神经网络算法,获得动脉粥样硬化的识别模型;

所述分析采用QIIME2,Silva数据库,DIAMOND,NCBI Blast nr数据库或MEGAN系统中的一种或多种;

所述分析包括质量控制、比对、距离矩阵计算、操作分类单元(OTU)划分、多样性分析、系统进化树构建和信号通路或差异菌群功能注释+中的一种或多种。

2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,步骤1中所述待测样本包括粪便或口腔分泌物。

3.根据权利要求2所述的构建方法,其特征在于,所述口腔分泌物包括唾液或痰液。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于复旦大学泰州健康科学研究院,未经复旦大学泰州健康科学研究院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201810010227.2/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

同类专利
专利分类
×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top