[发明专利]胶质瘤预后标志物circ19:47362476|47362693及应用有效
申请号: | 201711453853.0 | 申请日: | 2017-12-28 |
公开(公告)号: | CN107937536B | 公开(公告)日: | 2020-07-17 |
发明(设计)人: | 武明花;孟舒娟;李沛瑶;刘强;王蓉;刘庆;范礼 | 申请(专利权)人: | 中南大学湘雅医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/113 |
代理公司: | 长沙市融智专利事务所(普通合伙) 43114 | 代理人: | 袁靖 |
地址: | 410008 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 胶质 预后 标志 circ19 47362476 47362693 应用 | ||
本发明公开了一种胶质瘤预后标志物circ 19:47362476|47362693及应用,即检测胶质瘤组织中circRNA circ 19:47362476|47362693的试剂用于制备胶质瘤患者的预后制剂。通过研究证实胶质瘤中circRNA circ 19:47362476|47362693表达量较高的患者,术后生存率更高。通过检测胶质瘤患者胶质瘤组织中circRNA circ 19:47362476|47362693的表达水平,从而对胶质瘤患者做出预后判断。
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及一种用于胶质瘤预后的circRNA标志物、以及检测该标志物的试剂用于制备胶质瘤预后制剂的应用、还有试剂盒。
背景技术
脑胶质瘤是成年人最为频发的脑肿瘤疾病,占颅内肿瘤的40.49%。从确诊开始,脑胶质瘤患者平均生存寿命不超过五年。为了诊治胶质瘤这种与遗传物质相关性极高的恶性疾病,必须在分子生物学水平,从遗传信息表达的方面来探索其发病机理。目前而言胶质瘤的诊断和治疗方法虽处于不断改进阶段,但是胶质瘤患者生存率并没有明显提高。胶质瘤诊断仍然处于以临床、病理学和影像学信息为基础的经验性阶段,而且一经诊断,绝大多数均为中晚期,手术后的生存率不容乐观。因此,寻找胶质瘤预后标志物对患者进行预后分析,以提高胶质瘤患者的术后生活质量,并相应地选择合理的后续治疗方案,提高生存率,是神经科学领域亟待解决研究任务。
circRNA是一类广泛且多样地存在于哺乳动物细胞中、具有调控基因表达作用的内源性非编码RNA分子,具有共价闭合的环形结构,广泛存在于各种细胞中,也是继microRNA(miRNA)后RNA家族的最新研究热点。近年来,随着深度测序技术的广泛应用和生物物理和信息学技术的快速发展,人们发现人类许多外显子的转录本可被非线性地反向剪接或通过基因重排而形成circRNA,且它们在所有剪接转录本中占了相当大的比例,并具有丰富性、稳定性、高保守性和时空特异性等特征,有作为诸多疾病分子标志物的潜力。
发明内容
本发明的第一个目的是:提供一种用于胶质瘤患者预后的胶质瘤组织来源的circRNA标志物circ 19:47362476|47362693,其序列如SEQ NO:1所示。
本发明的第二个目的是,提供检测所述的circRNA标志物在胶质瘤组织中表达量的试剂在制备胶质瘤预后制剂中的应用。
本发明的第三个目的是,提供一种胶质瘤预后试剂盒,能够测定胶质瘤组织中的circ 19:47362476|47362693的含量。
所述的胶质瘤预后试剂盒,含有检测circ 19:47362476|47362693含量的PCR引物。优选引物的序列如SEQ NO:2和3所示。
所述的胶质瘤预后试剂盒,除circ 19:47362476|47362693的引物外,还含有从胶质瘤组织中提取RNA并进行逆转录及荧光定量PCR的所有试剂。包括:
(1)从胶质瘤组织中抽提总RNA所用试剂,包括RNA稳定溶液、Trizol试剂、三氯甲烷、异丙醇、无酶水;
(2)以总RNA为模板将circ 19:47362476|47362693逆转录为cDNA所用试剂,包括逆转录缓冲液、三磷酸碱基脱氧核苷酸、RNA酶抑制剂、MMLV逆转录酶以及circ 19:47362476|47362693所用随机引物;
(3)将cDNA实时定量PCR所用试剂,包括circRNA circ 19:47362476|47362693实时荧光定量PCR特异性引物、GAPDH内参特异性PCR引物、实时荧光定量SYBR染料、无酶水。
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