[发明专利]一种基于miRNA的疾病间关系分析方法和装置

说明书

本发明提供了一种基于miRNA的疾病间关系分析方法和装置。其中，所述方法包括：根据患有目标疾病的患者和正常对照人群的miRNA表达，构建miRNA功能类信息；获取疾病类别信息；计算所述miRNA功能类信息与所述疾病类别信息之间的类间距离；根据所述类间距离构建复合网络，并生成与所述目标疾病相对应的疾病关系信息。本发明所提供的方法分析结果详细、精确，应用性强，既可以应用于分子层面的复杂疾病并发症预测分析的相关理论研究，又可以同时应用于临床的多种复杂疾病的康复评价，对生物学及医学相关领域的分析具有重要意义。

技术领域

本发明涉及生物信息技术领域，更具体地说，涉及一种基于miRNA的疾病间关系分析方法和装置。

背景技术

疾病的发生通常为一个复杂的过程，且多种疾病之间常有并发的症状或引起相关疾病，目前研究认为，疾病的发生往往存在一些潜在的关键的生物过程。

现在的医学已经非常清楚，某一类的基因变异的确和某一类疾病之间存在非常大的关联。例如，现在已经确定容易患阿尔茨海默病和乳腺癌的人身上携带有某种基因变异，也就是携带这种变异基因的人患这两类病的风险大大高于正常人。疾病和基因变异的联系还可以用来解释为什么有些吸烟的病人患上肺癌的概率很高而有些吸烟的人却根本不会因此患上肺癌。基因与疾病之间实际上存在着非常复杂的关联。对于由单一遗传基因引起的疾病如血友病和囊胞性纤维症，这种关联就非常的简单。但对某些疾病而言，通过基因起作用而致病的条件会非常复杂，进而通过基因分析疾病之间的关系变得更加困难。

目前，对于疾病之间的关系进行分析的方法，一般包括通过大数据进行的全数据库病例的分析，或者是局限于基因层面进而根据基因分析疾病之间的关系情况，导致分析结果粗略、笼统、不精确，应用性较差、准确度低，给医务工作者和科研人员的研究、治疗工作带来极大的不便。

发明内容

有鉴于此，本发明提供一种基于miRNA的疾病间关系分析方法，包括：

S1，根据患有目标疾病的患者和正常对照人群的miRNA表达，构建miRNA功能类信息；

S2，获取疾病类别信息；

S3，计算所述miRNA功能类信息与所述疾病类别信息之间的类间距离；

S4，根据所述类间距离构建复合网络，并生成与所述目标疾病相对应的疾病关系信息。

优选地，所述S1包括：

S11，计算患有目标疾病的患者和正常对照人群的每个miRNA表达间的表达差异，并根据所述表达差异筛选出包含有特征miRNA的特征miRNA集合；

S12，计算所述特征miRNA集合中的特征miRNA间的序列相似性和靶基因集合的相似性，得出距离矩阵；

S13，根据所述距离矩阵构建miRNA功能类信息。

优选地，所述S11包括：

S111，计算患有目标疾病的患者和正常对照人群的每个miRNA表达间的表达差异；

S112，根据所述表达差异，筛选出在疾病状态下和正常状态下差异表达的特征标志物，并生成所述特征miRNA集合。

优选地，所述S12，包括：

S121，计算所述特征miRNA集合中每两个特征miRNA间的序列相似性，根据所述序列相似性得到序列距离分数；

计算所述特征miRNA集合中每两个特征miRNA间的所述靶基因集合的相似性，根据所述靶基因集合的相似性得到靶基因距离分数；

S122，根据所述序列距离分数和所述靶基因距离分数，构建距离矩阵。

优选地，所述S3包括：