[发明专利]一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法和试剂盒及应用

说明书

本发明公开一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法和试剂盒及应用。本发明将光倒刺鲃的黑素皮质激素受体的启动子第‑686位和第‑522位核苷酸分别命名为SNP1和SNP2，并进行检测；第SNP1位为CT杂合子时为快速生长群体，为C纯合子时为次快速生长群体，为T纯合子时为劣势群体；第SNP2位为AG杂合子时为快速生长群体，为G纯合子时为次快速生长群体，为A纯合子时为劣势群体；由于微效基因的加性效应，当SNP1位点和SNP2位点均为杂合子时生长速度最快，当两个位点中只有一个是杂合子另一个是生长较快的纯合子时，生长速度次之，其他以此类推。依据该方法，得到试剂盒，并用于光倒刺鲃快速生长个体的快速筛选中。

技术领域

本发明属于水产遗传和分子育种技术领域，特别涉及一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法和试剂盒及应用。

背景技术

光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)属鲤形目，鲤科，鲃亚科，倒刺鲃属。具有个体大、生长快、食性广、耐低氧、抗病力强、易养殖等优点。分布于长江、钱塘江、闽江、九龙江、珠江、元江、台湾岛及海南岛等诸水系。由于光倒刺鲃近亲繁殖，肆意杂交导致光倒刺鲃的种质资源遭到破坏，使其物种退化，造成减产，易感病等结果，对于光倒刺鲃的种质改善是当下亟待解决的问题。

单核苷酸多态性，全称(Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs)，是指在基因组上单个核苷酸的变异，包括转换、颠换、缺失和插入，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富。在人类的基因组中每1000个碱基中，就存在一个SNP。在鱼类中，SNP可能会影响到鱼类的免疫，代谢，耐低氧程度，生长性状等等，以SNP作为分子标记进行辅助育种，将会极大地提高筛选的速度以及准确率。

黑素皮质激素受体(Melanocortin-4Receptor，MC4R)，是一种G蛋白偶联受体，与体内的能量平衡，脂肪代谢，平衡等其他方面有着广泛的影响。MC4R由于是重要的生长性状控制基因，该基因的多态性也会导致生物生长指标的多态性，对MC4R的研究有着很大的经济价值，所以近年来在畜牧业和渔业对该基因十分关注。

目前，还没有关于光倒刺鲃的MC4R SNP与光倒刺鲃生长特性的相关研究报道。

发明内容

本发明的首要目的在于克服现有技术的缺点与不足，提供一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法。

本发明的另一目的在于提供一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的试剂盒。

本发明的再一目的在于提供所述的快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法以及试剂盒的应用。

本发明的目的通过下述技术方案实现：一种快速筛选光倒刺鲃快速生长个体的方法，包括如下步骤：

(1)将光倒刺鲃的黑素皮质激素受体的启动子第-686位和第-522位核苷酸分别命名为SNP1和SNP2，并进行检测；

(2)依据如下标准进行筛选：

①第SNP1位为CT杂合子时为快速生长群体；为C纯合子时为次快速生长群体；为T纯合子时为劣势群体；

②第SNP2位为AG杂合子时为快速生长群体；为G纯合子时为次快速生长群体；为A纯合子时为劣势群体；

③由于微效基因的加性效应，当SNP1位点和SNP2位点均为杂合子时生长速度最快；当两个位点中只有一个是杂合子另一个是生长较快的纯合子时，生长速度次之；其他以此类推，即按生长速度，SNP1位点和SNP2位点均为杂合子＞SNP1位点和SNP2位点中一个为杂合子且另一个为生长较快纯合子(C纯合子或G纯合子)＞SNP1位点和SNP2位点均为生长较快纯合子(C纯合子和G纯合子)＞SNP1位点和SNP2位点中一个为杂合子且另一个为生长较慢纯合子＞SNP1位点和SNP2位点中一个为生长较快纯合子且另一个为生长较慢纯合子＞SNP1位点和SNP2位点均为生长较慢纯合子(T纯合子和A纯合子)。