[发明专利]与玉米抗丝黑穗病次主效位点连锁的分子标记DNdCAPS8.03-1及其应用有效

申请号：	201611147933.9	申请日：	2016-12-13
公开（公告）号：	CN106636386B	公开（公告）日：	2020-09-25
发明（设计）人：	王振华;邸宏;张林;张晓明;周璇	申请（专利权）人：	东北农业大学
主分类号：	C12Q1/6895	分类号：	C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司：	北京科龙寰宇知识产权代理有限责任公司 11139	代理人：	孙皓晨;马鑫
地址：	150030 黑龙***	国省代码：	黑龙江;23
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摘要：
搜索关键词：	玉米黑穗病次主效位点连锁分子标记 dndcaps8 03 及其应用
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【权利要求书】：

1.一种基于与玉米抗丝黑穗病次主效位点连锁的SNP位点开发dCAPS分子标记的方法，其特征在于所述的SNP位点位于玉米基因组bin8.03区域的抗病候选基因GRMZM2G047152的开放阅读框中的第3169位，当该位点为G时，表现为抗病，当该位点为A时表现为感病；所述的GRMZM2G047152的开放阅读框的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；

以含有与玉米抗丝黑穗病次主效位点连锁的SNP位点的序列为基础序列，设计dCAPS引物对，以玉米总DNA为模板进行PCR扩增，使SNP位点有效的转化为dCAPS分子标记；其中所述的含有与玉米抗丝黑穗病次主效位点连锁的SNP位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.1；

所述的dCAPS引物对的序列如下所示：

上游引物：5’AGCTCAACGCAATTCATTGTGC 3’

下游引物：5’CGCTCACTGCCAAGTTTTGC 3’。

2.按照权利要求1所述的方法得到的与玉米抗丝黑穗病次主效位点连锁的dCAPS分子标记，命名为DNdCAPS8.03-1，该分子标记的内切酶为BsiHKAI，酶切位点为GWGCWC。

3.获得权利要求2所述的与玉米抗丝黑穗病次主效位点连锁的dCAPS分子标记的引物对，所述的引物对的序列如下所示：

上游引物：5’AGCTCAACGCAATTCATTGTGC 3’

下游引物：5’CGCTCACTGCCAAGTTTTGC 3’。

4.权利要求2所述的与玉米抗丝黑穗病次主效位点连锁的dCAPS分子标记在玉米抗丝黑穗病分子标记辅助育种中的用途。

5.如权利要求4所述的用途，其特征在于，所述的与玉米抗丝黑穗病次主效位点连锁的dCAPS分子标记与位于bin2.09主效抗病位点区域的分子标记MZA6393和LSdCAP2联合使用。

6.权利要求 3所述的引物对在玉米抗丝黑穗病分子标记辅助育种中的用途。

7.如权利要求6所述的用途，其特征在于，所述的引物对与位于bin2.09主效抗病位点区域的分子标记MZA6393和LSdCAP2联合使用。