[发明专利]一种番茄黄曲叶病毒LAMP检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201610091777.2 | 申请日: | 2016-02-19 |
公开(公告)号: | CN105525042A | 公开(公告)日: | 2016-04-27 |
发明(设计)人: | 彭冬青 | 申请(专利权)人: | 彭冬青 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/94 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 050011 河*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 番茄 黄曲叶 病毒 lamp 检测 试剂盒 方法 | ||
技术领域
本发明涉及微生物检测领域,具体地说,本发明涉及一种番茄黄 曲叶病毒LAMP检测试剂盒及检测方法。
背景技术
番茄是常见的可食用植物,其营养丰富、风味特别,具有减肥瘦 身、消除疲劳、增进食欲、促进蛋白质消化等功效,原产南美洲,在 我国广泛栽培。然而,1964年Cohen等首次报道了在以色列发生的 番茄黄曲叶病毒病。在之后的几十年间,该病迅速地扩散到中东、地 中海沿岸、东亚、南亚、非洲、欧洲、美国、中美洲、澳大利亚等众 多国家和地区。2002年传入我国南部省份,首先在广西大面积暴发, 同年传入江浙一带,随后在各个省份相继发现、连续暴发,给我国的 番茄生产造成重大损失。
番茄黄曲叶病毒病的病原体是番茄黄曲叶病毒(Tomatoyellow leafcurlvirus,TYLCV),是对番茄产量影响最严重的病害之一,主要 由烟粉虱传播。番茄植株感染该病毒后,最典型的症状是病株生长迟 缓或停滞,节间变短,严重矮化,枝条直立丛簇,叶片明显变小、增 厚、皱缩,叶质脆硬,向上卷曲呈杯、盘状,植株顶部形似菜花;病 叶边缘至叶脉区域黄化,植株上部叶片症状尤其明显;大部分花穗凋 萎,结果稀少,果实变小,膨大速度慢,成熟期的果实不能正常转色。 番茄在开花以前遭受TYLCV侵染,危害极其严重,果实产量和商品 价值均大幅度下降,严重时造成的损失可达100%。
番茄黄曲叶病毒病的症状并不是一成不变的,而是随着病毒株 系、番茄品种、植株年龄以及侵染时间的不同而改变,难以鉴别。此 外,番茄病毒病的种类很多,经常是多种病毒同时发生,如黄瓜花叶 病毒(CMV)、番茄花叶病毒(ToMV)等,构成混合侵染,因此田 间症状往往十分复杂,不易辨认。目前检测番茄黄曲叶病毒多使用血 清学测定或PCR法,然而这两种方法均存在不足:前者须制作抗血 清,非特异反应多,易产生假阳性或假阴性结果,而PCR灵敏度和 特异性不高,导致检测结果的准确性较低。因此,有必要开发一种快 速、准确的TYLCV检测方法,以满足产业需求。
环介导恒温核酸扩增技术(loop-mediatedisothermalamplification, LAMP)是近些年发展起来的一种新型的核酸扩增方法(见文献 NotomiT,OkayamaH,MasubuchiH,YonekawaT,WatanabeK,Amino N,HaseT.Loop-mediatedisothermalamplificationofDNA.Nucleic AcidsRes.2000Jun15;28(12):E63)。该技术不仅能够在恒温条件下 对目的序列进行快速扩增,且与常规PCR相比,无需高端的仪器设 备,可以通过在扩增产物中加入荧光染料进行直接判断或者通过观察 扩增曲线变化判断扩增结果,因此具有特异性强、灵敏度高、易于判 读、可定性定量等优势。目前LAMP技术已经应用于多种动植物病 毒的快速检测,并随着该技术的成熟,使用范围也越来越广。
发明内容
本发明的目的在于提供一种番茄黄曲叶病毒LAMP检测试剂盒 及检测方法。
为了实现本发明的目的,在一个方面中,本发明提供一种番茄黄 曲叶病毒LAMP检测试剂盒,其包括特异性引物、反应缓冲液、Bst DNA聚合酶和核酸染料,其中所述引物的核苷酸序列如下所示:
外引物F3:TGAAGAATGATTTGCGGGATA(SEQIDNO:1)
外引物B3:GCATGCGTACATGCCATA(SEQIDNO:2)
内引物FIP:CCTGTTCCTTCATTCCAGAGGG-TTCAAGTGA
TGAGGAAATTTCATG(SEQIDNO:3)
内引物BIP:ACGTAACTTATAATCATCAGGAGGC-CAATAA
CAAGGCGTTTTCAGT(SEQIDNO:4)。
优选地,所述外引物F3和所述外引物B3的浓度均为5pmol/μl, 所述内引物FIP和所述内引物BIP的浓度均为40pmol/μl。
优选地,所述反应缓冲液由10mMdNTP、10×ThermoPol反应缓 冲液、5mM甜菜碱和50mMMgSO4组成。
优选地,所述核酸染料为SYBRGreenI。
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