[发明专利]基于AllGlo探针的rs3909184检测分型试剂盒及其分型方法在审
申请号: | 201610083676.0 | 申请日: | 2016-02-06 |
公开(公告)号: | CN105483279A | 公开(公告)日: | 2016-04-13 |
发明(设计)人: | 张忠英;方宜臻 | 申请(专利权)人: | 厦门大学附属中山医院;张忠英 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 厦门南强之路专利事务所(普通合伙) 35200 | 代理人: | 马应森 |
地址: | 361004 福建省厦*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 allglo 探针 rs3909184 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
1.基于AllGlo探针的rs3909184检测分型试剂盒,其特征在于包括实时荧光定量PCR 试剂、阳性对照及阴性对照;
所述rs3909184为美国国家生物技术信息中心所提供的SNP位点编号。
2.如权利要求1基于AllGlo探针的rs3909184检测分型试剂盒,其特征在于所述实时荧 光定量PCR试剂包括以下组份:10×Taq缓冲液、10mmol的MgCl2、5u/μL的TaqHotstart DNA聚合酶、10mmoldNTPs混合液、50×LowROX、100mL无核酶水、10μmol/L rs3909184的特异正向引物、10μmol/Lrs3909184的特异反向引物和AllGlo探针;所述 10×Taq缓冲液包括100mmolTris-HCl和500mmolKCl。
3.如权利要求1基于AllGlo探针的rs3909184检测分型试剂盒,其特征在于所述rs3909184 的特异正向引物的核苷酸序列为:
SEQIDNO.1:5'-CTCTGATGAGCCCCCGTTT-3';
所述rs3909184的特异反向引物的核苷酸序列为:
SEQIDNO.2:5'-ATGTGCTCAGTGCCCTCAAG-3'。
4.如权利要求1基于AllGlo探针的rs3909184检测分型试剂盒,其特征在于所述AllGlo 探针为rs3909184的特异探针,其核苷酸序列为:
SEQIDNO.3:rs3909184-C:MAR-CCACCTGTGCCC-MAR;
SEQIDNO.4:rs3909184-G:JUP-CCACGTGTGCCC-JUP。
5.如权利要求1基于AllGlo探针的rs3909184检测分型试剂盒,其特征在于所述阳性对 照包括:阳性纯合对照品1、阳性纯合对照品2、阳性杂合对照品;所述阳性纯合对照品1为 rs3909184分型为GG的DNA样品,所述阳性纯合对照品2为rs3909184分型为CC的DNA 样品,所述阳性杂合对照品为rs3909184分型为GC的DNA样品。
6.如权利要求1基于AllGlo探针的rs3909184检测分型试剂盒,其特征在于所述阴性对 照为1mL的无核酶水。
7.基于AllGlo探针的rs3909184检测分型方法,其特征在于其步骤如下:
1)采用常规方法提取EDTA抗凝全血样本中的DNA;
2)采用如权利要求1~6中任一所述基于AllGlo探针的rs3909184检测分型试剂盒提供的 实时荧光定量PCR试剂将DNA进行实时荧光定量PCR扩增;
3)根据检测到的荧光信号对rs3909184SNP位点进行分型。
8.如权利要求1基于AllGlo探针的rs3909184检测分型试剂盒,其特征在于所述AllGlo 探针采用美国A1leLogicBiosciencesCorporation公司的荧光定量探针。
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