[发明专利]奶山羊泌乳相关miR-196a基因的单核苷酸多态性的检测方法及其应用无效
申请号: | 201210371982.6 | 申请日: | 2012-09-29 |
公开(公告)号: | CN102839171A | 公开(公告)日: | 2012-12-26 |
发明(设计)人: | 陈宏;李转见;郭文娇;蓝贤勇;黄永震;孙加节;王璟 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68;A01K67/027 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人: | 汪人和 |
地址: | 712100 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 山羊 相关 mir 196 基因 核苷酸 多态性 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种奶山羊miR-196a基因的单核苷酸多态性,其特征在于,其基因单核苷酸多态性包括:
在如SEQ ID No.1所示的奶山羊miR-196a基因序列中,其第340位为C或T的单核苷酸多态性。
2.一种奶山羊miR-196a基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)以包含miR-196a基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增奶山羊miR-196a基因;
所述的引物对P为:
正向引物:CAGTCGGTTATCGTCGAGGGCCCGAA;
反向引物:GACCTCCTTTGTCTGTCTCCAT;
2)用限制性内切酶HinfI消化PCR扩增产物,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定奶山羊miR-196a基因序列中第340位的单核苷酸多态性:
CC基因型表现为265bp条带;CT基因型表现为265,241和24bp条带;TT基因型表现为241和24bp条带。
3.如权利要求2所述的奶山羊miR-196a基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,所述的PCR扩增的反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸30s,35个循环;72℃延伸10min。
4.如权利要求2所述的奶山羊miR-196a基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,所述琼脂糖凝胶电泳为1.5%的琼脂糖凝胶电泳。
5.如权利要求2所述的奶山羊miR-196a基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,将奶山羊miR-196a基因第340位SNP位点的CT基因型作为有效DNA标记。
6.如权利要求5所述的奶山羊miR-196a基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于,所述的有效DNA标记为:
CT基因型作为奶山羊泌乳性状的标记辅助选择育种中提高奶山羊第二、三胎泌乳量的分子遗传标记。
7.权利要求1所述的奶山羊miR-196a基因的单核苷酸多态性在奶山羊标记辅助选择中的应用。
8.如权利要求7所述的应用,其特征在于,奶山羊miR-196a基因第340位的单核苷酸多态性中的CT基因型作为奶山羊泌乳性状的标记辅助选择育种中提高奶山羊第二、三胎泌乳量的分子遗传标记。
9.权利要求1所述的奶山羊miR-196a基因的单核苷酸多态性在区分绒山羊与奶山羊的分子遗传标记中的应用。
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