[发明专利]用于检测AML-EVI1融合基因相对表达量的试剂盒

说明书

技术领域

本发明属生命科学和生物技术领域，特别是一种基因检测试剂盒，采用探针实时荧光定量PCR技术，能够对人类慢性髓细胞性白血病(chronic myelognous leukemia，CML)患者体内AML1- EVI1融合基因表达水平进行检测，可有效的节约检测时间，提高检测精度。

背景技术

白血病是一类造血干细胞异常的克隆性恶性疾病。在骨髓和其他造血组织中白血病细胞大量增生积聚并浸润其他器官和组织，同时使正常造血受抑制，临床表现为贫血、出血、感染及各器官浸润症状。根据白血病细胞的成熟程度和自然病程，白血病可分为急性和慢性两大类。急性白血病病情进展迅速,自然病程仅有数周至数月。一般可根据白血病细胞系列归属分为急性髓系白血病(AML)和急性淋巴细胞白血病(ALL)两大类。而慢性白血病常见的有慢性粒细胞性白血病（CML）、慢性淋巴细胞性白血病（CLL）。由于白血病类型不同，治疗方案及预后亦不尽相同。 

慢性髓细胞性白血病，简称慢粒（chronic myelognous leukemia ，CML），是临床上一种起病及发展相对缓慢的白血病。病程从数月到数年不等,临床上该病可分为3期：慢性期、加速期和急变期(CML-BC)，初诊时大部分患者为慢性期，一般在确诊2-5 年内由慢性期进展到加速期，最后发展到急变期（CML-BC），急变后化疗有效率不超过30%，中位生存期1-13个月，预后极差。CML-BC 期可涉及所有系的造血细胞，而不同急变类型的预后及治疗原则不尽相同，此时细胞形态学和组织化学难以完全确定急变类型，需辅以免疫分型加以鉴别，结合细胞遗传学和分子生物学检查，有助于急变类型的诊断、治疗和预后的判断。

Nueifora等 报道的t(3；21)中，21号染色体上的AML1在runt区和转录激活区之间断裂并分别与MDS1和EVI1形成了AML1／MDS1和AML1／EVI1融合基因。在AML1／EVI1转录本中，AML1的第5个外显子被连接到EVI1的第2个非翻译外显子，导致了一个长的复合多肽的产生，它包含了AML1的runt区和几乎全部EVI1。AML1／EVI1编码一个180 kD的融合蛋白，含3个DNA结合区。近年来，许多临床和实验观察都显示，慢粒急变期，除bcr／abl融合基因外，60％-80％还呈现某些新的细胞或分子遗传学改变。其中AML1／EVI1融合基因也是慢粒急性变的重要机制之一。EVI1与AML1基因融合产生的AML1／EVI1融合蛋白具有双重的功能，一方面阻断分化；另一方面则刺激增殖，这分别依赖于AML1上的结构域和EVI1的第2个锌指结构域。众多报道显示，慢粒急变EVI1阴性的患者中，可能部分患者EVI1基因产生了融合，使用EVI1特异性的引物则检测不出。若使用更敏感的方法同时检测AMLI／EVI1融合基因可能会提高慢粒急性变的预测性。

目前临床上已经将AML1-EVI1融合基因作为动态评估患者病情及预后的手段之一。常用的检测技术有荧光原位杂交技术(FISH)、RT-PCR、RQ-PCR等方法。FISH法尽管结果较为直观，但是试验过程繁琐，涉及试剂种类繁多，费时费力，且结果需经验丰富的专业人士来判读，结果判读存在较大的主观性。而单纯RT-PCR法则为终点定量，无法对起始模板量进行准确的估算。此外，由于砷剂及全反式维甲酸的应用，APL治疗效果得到很大的提高，微小残留病是其复发的主要原因，因而急需一种高敏感性、高特异性、高自动化程度、污染控制好的方法来对AML1-EVI1融合基因mRNA残留进行检测。

RQ-PCR采用Taqman探针荧光定量技术，综合生物学、酶学和荧光化学于一体，从扩增到结果分析均在PCR反应管封闭状态下进行，解决了PCR产物污染而导致假阳性的问题，同时也提高了敏感度，其结果用拷贝数表示，实现了对PCR产物的准确定量，易于统一标准，与定性PCR技术相比，具有特异度好，灵敏度高，线性关系好，操作简单，自动化程度高、防污染，有较大的线性范围等优点。能够满足AML1-EVI1融合基因mRNA微量残留的检测，被认为是目前首选检测方法，用于评价治疗效果、预测预后。实时荧光定量PCR中常见的方法有SYBR GreenI染料法， 双探针杂交法以及Taqman技术等。其中SYBR GreenI由于是非饱和染料，特异性不如双探针杂交法以及Taqman法，必须通过观察溶解曲线来判断其特异性；而双探针法杂交法成本又较为昂贵。因此本研究采用实时荧光PCR技术结合Taqman探针法应用于AML1-EVI1的基因检测。

发明内容