[发明专利]一种SLCO1B3基因多态性检测特异性引物和液相芯片无效

专利信息
申请号: 201110251666.0 申请日: 2011-08-29
公开(公告)号: CN102952872A 公开(公告)日: 2013-03-06
发明(设计)人: 许嘉森;何嘉英 申请(专利权)人: 广州益善生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 代理人: 万志香;曾旻辉
地址: 510663 广东省广州市广州科*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 slco1b3 基因 多态性 检测 特异性 引物 芯片
【说明书】:

技术领域

发明属于分子生物学领域,涉及医学和生物技术,具体的是涉及一种SLCO1B3基因多态性检测特异性引物和液相芯片。

背景技术

有机阴离子转运多肽OATP1B3(又称organic anion-transporting polypeptide 8,OATP8,编码基因SLCO1B3),OATP1B3药物转运体在耐药和药代动力学方面起到非常重要的作用,它与药物的耐受、吸收、分布、排泄、药效发挥、以及药物毒性作用等密切相关。有研究表明,SLCO1B3基因多态性与其编码蛋白的活性密切相关。

目前,对SLCO1B3基因多态性进行检测和分析的方法很少,主要有直接测序法和PCR-RFLP分析法,其中最常用的方法有PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变,如位点丢失或产生新位点,通过PCR扩增某一特定片段,再用限制性内切酶酶切扩增产物,电泳观察片段的大小,这种方法用于检测酶切位点改变的基因突变,可直接判断基因型,但该法不能用于没有产生新酶切位点的基因突变检测。再次,以上这些方法都存在着检测通量的局限性,每次只能检测一种突变类型,不能满足实际应用的需要。

本发明目标检测的SLCO1B3基因突变位点(多态性位点),如表所示:

  序号  SLCO1B3位点突变的内容  简写  1  SEQ ID NO.21的第182位核苷酸,发生T→G突变  T182G  2  SEQ ID NO.22的第77位核苷酸,发生G→A突变  G77A

SEQ ID NO.21-22的具体序列组成如下:

SEQ ID NO.21

CATTTGGGGCATTCAGTTCTACTAGATACAAAATTACACTAAGTCATATCAACATAATTTTGTTTTTTTTCTAGGAAATTTGCTTGTGATTGTATTTGTAAGTTACTTTGGATCTAAACTACACAGACCGAAGTTAATTGGAATTGGTTGTCTCCTTATGGGAACTGGAAGTATTTTGACATCTTTACCACATTTCTTCATGGGATAGTAAGTGTTAAACAGCTCTGAGCCATTTATTATCAGCTACTTGTAAATTAGCAGTAGAATTTTATTTTTATACTTGTAAGTGGGCAGTTACCTTTTGAGAGGAATACCSEQ ID NO.22。

TTACAGGTAGTTTGAATGCAATAGGAATGATTGGTCCAGTCATTGGCTTTGCACTGGGATCTCTGTTTGCTAAAATGTACGTGGATATTGGATATGTAGATCTGAGTAAGTACAATTAGAACAAGGTACCATGATAGTGTCTTTTAAGTGCAGGACACCATTCTTCCAAAGAATTAAATTCAGTCTTTCAATAGTTCTTTGTT。

发明内容

本发明的目的之一是提供SLCO1B3基因多态性检测液相芯片。该液相芯片可用于单项或者并行检测SLCO1B3基因两种常见基因型T182G和G77A的野生型和突变型。

实现上述目的的技术方案如下:

一种SLCO1B3基因多态性检测液相芯片,包括有:

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