本发明公开了一种抑制鸡SOX5基因表达的shRNA序列及其应用,所述shRNA序列分别为SOX1312、SOX1635和SOX628,其中,SOX1312‑a正义链和SOX1312‑b反义链分别为SEQID NO:1和SEQ ID NO:2所示,SOX1635‑a正义链和SOX1635‑b反义链分别为SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示,SOX628‑a正义链和SOX628‑b反义链分别为上述三种shRNA序列均可有效降低鸡SOX5基因的表达量,在基因水平的抑制效率分别为62%、80%和90%。