本发明涉及分子生物学中的基因技术领域，具体涉及葡萄生根调控基因PCNT及其编码蛋白与应用。所述生根调控基因PCNT全长为由SEQ ID NO.1所示核苷酸序列组成，PCNT基因编码区(ORF)核苷酸序列如SEQ IN NO.2所示，其蛋白序列由SEQ ID NO.3所示。本发明从“巨峰”葡萄中，经过激光量子诱变结合三次赤霉素浸泡后，剪取葡萄的根，提取总RNA后纯化获得mRNA，构建cDNA文库，然后挑选阳性克隆测序，获得了PCNT基因序列信息。经过两端RACE技术，扩增获得了PCNT基因全长序列。然后将其在葡萄中过表达，获得生根数量较多的转基因葡萄植株。该基因在葡萄的生根调控中发挥了关键作用。
本发明涉及PCNT基因第五号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第五号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第五号外显子的第256位的A－＞G多态性。该SNP导致编码蛋白第62位发生Lys(K)－＞Glu(E)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第三十九号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第三十九号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第三十九号外显子的第441位的A－＞G多态性。该SNP导致编码蛋白第104位发生Gln(Q)－＞Arg(R)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第三十九号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第三十九号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第三十九号外显子的第346位的T－＞C多态性。该SNP导致编码蛋白第116位发生Cys(C)－＞Arg(R)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第十号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第十号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第十号外显子的第328位的T－>C多态性。该SNP导致编码蛋白第53位发生Ile(I)－>Thr(T)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第十三号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第十三号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第十三号外显子的第268位的A－＞G多态性。该SNP导致编码蛋白第58位发生Glu(E)－＞Gly(G)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第十四号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第十四号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第十四号外显子的第215位的T－＞G多态性。该SNP导致编码蛋白第37位发生Met(M)－＞Arg(R)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第十五号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第十五号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第十五号外显子的第128位的A－＞G多态性。该SNP导致编码蛋白第9位发生Thr(T)－＞Ala(A)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第十六号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第十六号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第十六号外显子的第273位的T－＞C多态性。该SNP导致编码蛋白第91位发生Val(V)－＞Ala(A)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第十九号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第十九号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第十九号外显子的第219位的T－＞C多态性。该SNP导致编码蛋白第8位发生Cys(C)－＞Arg(R)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第三十三号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第三十三号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第三十三号外显子的第184位的A－＞G多态性。该SNP导致编码蛋白第19位发生Gln(Q)－＞Arg(R)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第四十六号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第四十六号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第四十六号外显子的第219位的A－＞C多态性。该SNP导致编码蛋白第11位发生Arg(R)－＞Ser(S)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第三十八号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第三十八号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第三十八号外显子的第209位的C－＞G多态性。该SNP导致编码蛋白第21位发生Gln(Q)－＞Arg(R)改变，从而改变了蛋白活性。
本发明涉及PCNT基因第三十六号外显子的单核苷酸多态性(SNP)。本发明提供了分析PCNT基因第三十六号外显子的SNP或其活性的方法。本发明的SNP是SEQ ID NO：1所示序列的人PCNT基因第三十六号外显子的第264位的A－＞G多态性。该SNP导致编码蛋白第51位发生Thr(T)－＞Ala(A)改变，从而改变了蛋白活性。
