本发明公开了一种虫黄藻来源的DHQS‑OMT融合基因及其在高效合成MAAs中的应用,属于生物技术领域。DHQS‑OMT融合蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明在虫黄藻转录组中,发现一个DHQS‑OMT融合基因,同时具有DHQS同源基因和甲基转移酶OMT的两个结构域,同时具有双重催化反应能力,可以高效催化生成MAA的前体分子4‑deoxygadusol。本发明首次合成了虫黄藻MAAs生物合成基因,其涉及生成一种紫外吸收物质,并成功将其克隆到原核表达载体上,获得蛋白,可应用到化妆品、防晒霜等生物医药领域。