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[发明专利]病原微生物的检测方法及装置-CN201511000616.X有效
发明人：周丰丰;麦国琴;仲任;姚曌旻;王誉 -专利权人：深圳先进技术研究院
申请日： 2015-12-28 - 公布日： 2018-08-14 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明适用于生物检测技术领域，提供了病原微生物的检测方法及装置，包括：将测试宏基因组作为查询序列输入到预设的病原微生物数据库中；在所述预设的病原微生物数据库中对所述测试宏基因组进行BLAST运算，得到所述预设的病原微生物数据库中每种病原微生物的运算结果，所述运算结果包括所述病原微生物与其在所述测试宏基因组中所匹配到的微生物的相似性和相似的长度，以及包括所述病原微生物在所述测试宏基因组中所匹配到的微生物的个数；根据所述运算结果获取每种病原微生物的平均匹配值；将所述平均匹配值和所述匹配到的微生物的个数最高的病原微生物确定为所述测试宏基因组的检测结果。本发明的检测过程无需序列拼接，简单、高效。
病原微生物检测方法装置

[发明专利]一种微生物耐药基因芯片试剂盒-CN201611052665.2在审
发明人：李寿乐 -专利权人：天津福德信泰生物科技有限公司
申请日： 2016-11-25 - 公布日： 2017-04-05 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种微生物耐药基因芯片试剂盒。该试剂盒包括扩增待测微生物基因的引物对和检测探针。该芯片包括检测待测微生物耐药基因的探针。一种微生物耐药基因芯片试剂盒，其特征在于包括扩增待测微生物耐药基因的引物对和检测所述细菌耐药基因的探针；所述引物具有如AEQ ID No1～32所示的序列或其互补链；所述探针具有如AEQ ID No33
一种微生物耐药基因芯片试剂盒

[发明专利]一种检测待测样品中各个微生物物种的基因组DNA拷贝数的方法-CN201911299156.3有效
发明人：曹德盼;任若通;饶冠华;贾雪峰;蒋智 -专利权人：北京金匙基因科技有限公司
申请日： 2019-12-17 - 公布日： 2022-01-04 - 主分类号： C12Q1/6851 文献下载
摘要：本发明公开了可以高通量检测待测样品中总细菌基因组DNA含量mbac、各个微生物物种的基因组DNA含量mi、各个微生物物种的基因组DNA拷贝数Ni和各个微生物物种细胞数Ui的犯法。采用本发明提供的方法和qPCR方法检测测试品，测得的各个物种基因组质量浓度，在不同微生物组成、不同微生物核酸比例下均具有极高的线性相关性，说明本发明提供的方法具有较高的准确性。本发明使得临床病原微生物宏基因组NGS检测方法得出的结果在不同样品之间具备可比性，将传统的临床病原微生物宏基因组NGS检测由定性检测方法提升为定量检测方法，具有重要的应用价值。
一种检测样品各个微生物物种基因组 dna 拷贝方法

[发明专利]病原微生物毒力基因关联模型及其建立方法和应用-CN202110055186.0在审
发明人：许腾;何福生;张俊杰;曾伟奇;李晓蕾;苟雪静;李永军;王小锐;苏杭 -专利权人：广州微远基因科技有限公司;广州微远医疗器械有限公司;广州微远医学检验实验室有限公司;深圳微远医疗科技有限公司;微远（深圳）医学研究中心有限公司
申请日： 2021-01-15 - 公布日： 2021-05-25 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明涉及一种病原微生物毒力基因关联模型及其建立方法和应用，属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：建立病原微生物基因数据库和毒力基因数据库；获取临床样本的病原微生物宏基因组测序数据，得到每个临床样本中病原微生物和所对应的毒力基因序列数据；对上述病原微生物的序列数据和毒力基因序列数据进行聚类分析，获得单个毒力基因与至少一个疑似关联病原微生物的正态分布模型，选取其中病原微生物丰度高且毒力基因序列数与病原微生物序列数强相关的模型，即得。采用该方法得到的病原微生物毒力基因关联模型，能够判断每种毒力基因究竟来源于哪种细菌，弥补了现有技术的缺陷，且具有适用范围广、准确性高的优点。
病原微生物毒力基因关联模型及其建立方法应用

[发明专利]病原微生物耐药基因归属模型及其建立方法和应用-CN202110055195.X有效
发明人：许腾;何福生;张俊杰;曾伟奇;张泽武;苟雪静;李永军;王小锐;苏杭 -专利权人：广州微远基因科技有限公司;广州微远医疗器械有限公司;广州微远医学检验实验室有限公司;深圳微远医疗科技有限公司;微远（深圳）医学研究中心有限公司
申请日： 2021-01-15 - 公布日： 2023-03-10 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明涉及一种病原微生物耐药基因归属模型及其建立方法和应用，属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：建立病原微生物基因数据库和耐药基因数据库；获取临床样本的病原微生物宏基因组测序数据，得到每个临床样本中病原微生物和所对应的耐药基因序列数据；对上述病原微生物的序列数据和耐药基因序列数据进行聚类分析，获得单个耐药基因与至少一个疑似来源病原微生物的正态分布模型，选取其中病原微生物丰度高且耐药基因序列数与病原微生物序列数强相关的模型，即得。采用该方法得到的病原微生物耐药基因归属模型，能够判断每种耐药基因究竟来源于哪种细菌，弥补了现有技术的缺陷，且具有适用范围广、准确性高的优点。
病原微生物耐药基因归属模型及其建立方法应用

[发明专利]基于磁珠法提取淤泥微生物基因组DNA的试剂盒-CN201510449610.4在审
发明人：王清水;余彦 -专利权人：福建师范大学
申请日： 2015-07-28 - 公布日： 2015-11-04 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明提供一种基于磁珠法提取淤泥微生物基因组DNA的试剂盒。所述的试剂盒经过淤泥微生物细胞的破碎、杂蛋白的抽除和磁珠法回收微生物基因组步骤，得到淤泥微生物基因组DNA，并于1%琼脂糖凝胶中电泳检测。该试剂盒主要是利用硅基磁珠特异性吸附基因组DNA的原理研发而成的，操作简便，大大缩短常规淤泥微生物基因组DNA提取流程，与常规的淤泥微生物基因组DNA提取方法相比更加方便、快捷，能够大规模的提取淤泥微生物基因组
基于磁珠法提取淤泥微生物基因组 dna 试剂盒

[发明专利]饲用微生物产品中菌种及风险基因的高通量检测方法-CN202111554053.4在审
发明人：李明;饶正华;孟庆石;冯潇慧;刘娜;焦京琳;谢秀兰 -专利权人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
申请日： 2021-12-17 - 公布日： 2022-01-28 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明属于农业技术领域，具体涉及饲用微生物产品中菌种及风险基因的高通量检测方法。本发明的饲用微生物产品中菌种的高通量检测方法，包括以下步骤：提取待测样品中的微生物的基因组DNA；进行高通量测序；对高通量测序结果进行数据分析，得到每种微生物的丰度；对微生物的丰度进行结果展示，展示结果显示为中文本发明的方法能有效提取饲用微生物产品中的总DNA，并准确筛选非靶向致病菌，对《饲料添加剂品种目录》中允许使用的菌种含量进行定量分析，可对饲用微生物产品中的耐药基因、可迁移耐药基因和毒力基因进行分析、中文说明目标基因的风险和菌种溯源，有效解决饲用微生物产品存在的问题。
微生物产品菌种风险基因通量检测方法

[发明专利]产生吡啶二羧酸的微生物聚生体和选择与运载体共配制的微生物的方法-CN201980052489.8在审
发明人： F·肯迪尔基;B·戈登 -专利权人：艾姆瓦克香港有限公司
申请日： 2019-06-05 - 公布日： 2021-07-23 - 主分类号： C12N1/20 文献下载
摘要：提供了选择与运载体共配制的微生物的方法。在一些实例中，所述方法包括鉴定包含一或多种吡啶二羧酸(DPA)合酶基因的微生物、表达一或多种DPA合酶蛋白的微生物和/或产生DPA的微生物；以及选择与运载体共配制的微生物。所述方法任选地包括将选定的微生物与运载体共配制。在一些实例中，所述方法包括检测微生物中的一或多种DPA合酶基因或一或多种DpaA和/或DpaB蛋白。在其他实例中，所述方法包括例如使用荧光测定检测微生物或含有微生物的培养基中的DPA。还提供了包含一或多种微生物的微生物组合物，所述微生物包含一或多种DPA合酶基因、表达一或多种DPA合酶蛋白和/或产生DPA。
产生吡啶二羧酸微生物聚生体选择运载配制方法

[发明专利]产生吡啶二羧酸的微生物聚生体和选择与运载体共配制的微生物的方法-CN202211302440.3在审
发明人： F·肯迪尔基;B·戈登 -专利权人：艾姆瓦克香港有限公司
申请日： 2019-06-05 - 公布日： 2023-04-25 - 主分类号： C12N1/20 文献下载
摘要：提供了选择与运载体共配制的微生物的方法。在一些实例中，所述方法包括鉴定包含一或多种吡啶二羧酸(DPA)合酶基因的微生物、表达一或多种DPA合酶蛋白的微生物和/或产生DPA的微生物；以及选择与运载体共配制的微生物。所述方法任选地包括将选定的微生物与运载体共配制。在一些实例中，所述方法包括检测微生物中的一或多种DPA合酶基因或一或多种DpaA和/或DpaB蛋白。在其他实例中，所述方法包括例如使用荧光测定检测微生物或含有微生物的培养基中的DPA。还提供了包含一或多种微生物的微生物组合物，所述微生物包含一或多种DPA合酶基因、表达一或多种DPA合酶蛋白和/或产生DPA。
产生吡啶二羧酸微生物聚生体选择运载配制方法

[发明专利]微生物益生性功能基因的检测方法及其应用-CN202110706218.9在审
发明人：刘淑艳;王庭璋;马云婷;孙晓飞;车阳 -专利权人：中国农业科学院农产品加工研究所
申请日： 2021-06-24 - 公布日： 2021-11-02 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明涉及微生物技术领域，具体涉及微生物益生性功能基因的检测方法及其应用。本发明的微生物益生性功能基因的检测方法包括：构建益生性功能基因数据库，将待测微生物的所有蛋白的序列在所述数据库中进行BLAST比对，根据阈值确定所述待测微生物含有的益生性功能基因，其中，所述阈值包括BLAST该方法可从蛋白序列水平，快速检测出菌株中含有的基础氨基酸和维生素合成代谢基因、抗菌活性基因、抗氧化基因、胞外多糖合成基因和降胆固醇基因的数目和具体信息，具有检测方便快捷、周期短、准确性较高的特点，为益生菌的评价和潜在益生菌菌株的筛选提供高效的技术手段
微生物生性功能基因检测方法及其应用

[发明专利]一种微生物宏基因组测序用标准品体系及其制备方法-CN202310901569.4在审
发明人：焦志军;邓国伟;陈胜兰;殷剑峰;范泽文;王春香 -专利权人：康为医学检验实验室（泰州）有限公司;北京健为医学检验实验室有限公司
申请日： 2023-07-20 - 公布日： 2023-09-19 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种微生物宏基因组测序用标准品体系及其制备方法，将肠道微生物的菌种按照细胞数比例混合得到微生物宏基因组测序标准品，可保存于菌种保存液中，保证细胞的完整性；将肠道微生物的菌种基因组DNA定量按照比例混合得到微生物宏基因组测序标准品本发明提供的宏基因组测序标准品的制备方法，可以混合10‑30种肠道微生物，更好的模拟肠道微生物的实际情况。本方法制备的微生物宏基因组测序标准品可用于生信建模、流程测试和开发；可作为微生物学或宏基因组学高通量建库测序的质控，评估检测流程稳定性，可靠度，一致性。
一种微生物宏基组测序用标准体系及其制备方法

[发明专利]用于扩增微生物醇脱氢酶基因片段的简并引物及所述简并引物的应用-CN202111520155.4在审
发明人：满都拉;任宇婷;孙子羽;陈忠军;乔美灵;张保军 -专利权人：内蒙古农业大学
申请日： 2021-12-13 - 公布日： 2022-05-13 - 主分类号： C12N15/53 文献下载
摘要：本发明提供用于扩增微生物醇脱氢酶基因片段的简并引物，还提供一种利用简并引物扩增微生物醇脱氢酶基因片段的检测方法，首先提取待测样品微生物总DNA作为模板，用简并引物进行PCR扩增，纯化后进行高通量测序，通过获取测序结果是否含有醇脱氢酶和GroES‑like蛋白的操作分类单元判断待测样品微生物中是否含有醇脱氢酶。本发明从醇脱氢酶氨基酸的结构域出发，设计出用于扩增微生物醇脱氢酶基因片段的简并引物，并应用于检测以确定醇脱氢酶基因，进而确定检测样品中含潜在产高级醇微生物种类及丰度大小，从而为样品中潜在产高级醇微生物组成的进一步研究奠定基础
用于扩增微生物脱氢酶基因片段引物应用

[发明专利]排除假阴性的PCR 检测方法和其中使用的引物-CN201180020046.4有效
发明人：下津智志;铃木康司 -专利权人：朝日啤酒株式会社
申请日： 2011-04-19 - 公布日： 2013-01-02 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供一种在微生物混入制品等时不进行假阴性判定而采用PCR法就能准确检测的PCR检测系统。本发明提供一种微生物检测方法，所述微生物检测方法包括：应用用于扩增样品中可能存在的微生物的靶基因序列的第1引物对以及用于扩增上述样品中的阳性对照基因序列的第2引物对进行PCR反应，其中，上述PCR反应中的上述靶基因的检测灵敏度和上述阳性对照基因的检测灵敏度是同等的
排除阴性 pcr 检测方法其中使用引物

[发明专利]一种基于高通量测序技术检测目的微生物基因组RNA的方法-CN202010809329.8在审
发明人：马珍子;林永权;吴红龙 -专利权人：深圳华大因源医药科技有限公司;南京华大医学检验所有限公司;深圳华大基因股份有限公司
申请日： 2020-08-12 - 公布日： 2022-02-22 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明属于高通量测序和微生物检测技术领域，具体涉及一种基于高通量测序技术检测目的微生物基因组RNA的方法。本发明方法包括对包含目的微生物的待测样本进行核酸提取、DNA消化、RNA纯化、RNA片段化、反转录合成cDNA分子、cDNA文库构建、高通量测序和测序数据分析，检测出样本中目的微生物基因组RNA的状况。本发明方法由于采用了温和的消化手段和热打断手段，可以高效、快速、低成本地富集微生物基因组RNA，提高微生物基因组RNA的含量，提高RNA高通量测序文库构建的成功率，从而提高微生物基因组RNA的检测灵敏度
一种基于通量技术检测目的微生物基因组 rna 方法

[发明专利]一种微阵列芯片在微生物检测中的应用-CN201711353447.7在审
发明人：许家峰 -专利权人：佛山市校友桥网络科技有限公司
申请日： 2017-12-15 - 公布日： 2018-03-27 - 主分类号： C12Q1/689 文献下载
摘要：本发明提出了一种微阵列芯片在微生物检测中的应用，适合于检测大规模基因表达等的研究，及微生物的定性分析。基于这种快速、高效的特点，微阵列生物芯片在生物学和医学等领域获得了广泛应用，包括测定基因或蛋白质表达图谱、研究特定的基因或蛋白质功能、研究分子间交互作用、寻找疾病的生物学标记、微生物鉴别以及微生物族群分析等
一种阵列芯片微生物检测中的应用

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