[发明专利]一种检测串联重复区域的方法、装置、设备及存储介质在审
| 申请号： | 202310204987.8 | 申请日： | 2023-03-06 |
| 公开（公告）号： | CN116206680A | 公开（公告）日： | 2023-06-02 |
| 发明（设计）人： | 董金新;袁甜婷;亓民勇;姜华;贾保先;张童;赵祖耀;周梦娇 | 申请（专利权）人： | 聊城大学 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B40/00;G06F18/2413;G06F18/15 |
| 代理公司： | 北京众达德权知识产权代理有限公司 11570 | 代理人： | 陈忠忠 |
| 地址： | 252000 山*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 一种检测串联重复区域的方法、装置、设备及储存介质，其方法包括：从缺失值和N位置处理后的基因组序列中提取读对深度和映射质量；校正GC偏差处理所述读对深度后，与所述映射质量经平滑去噪处理和标准化处理；经分类处理后得到异常点，筛选所述异常点，得到粗糙的串联重复区域；所述粗糙的串联重复区域经分裂读对方法和成对末端映射方法处理，得到细化的串联重复区域。该方法能够消除由于测序误差、映射误差和GC含量偏差等噪声造成的影响，使读对深度和映射质量分布均衡；且能够在低覆盖度和低肿瘤纯度情况下，将串联重复区域做进一步细化，从而获得更高准确度的串联重复区域。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 检测 串联 重复 区域 方法 装置 设备 存储 介质 | ||
【主权项】：
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