[发明专利]一种基于局部序列约束的启动子智能设计方法、装置及应用在审
| 申请号： | 202310100892.1 | 申请日： | 2023-01-18 |
| 公开（公告）号： | CN116052765A | 公开（公告）日： | 2023-05-02 |
| 发明（设计）人： | 汪小我;王昊晨;许涵文;张鹏程;魏磊 | 申请（专利权）人： | 清华大学 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B40/00;G16B30/20;G06N3/049;G06N3/0442;G06N3/045;G06N3/0475;G06N3/094 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 任凤华 |
| 地址： | 100084 北京市海淀区1*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于局部序列约束的启动子智能设计方法、装置及应用。本发明中的方法利用“侧翼序列填充”的知识‑模型共驱动学习策略来实现，将已有天然启动子的复杂调控规律利用数据进行学习，使用条件生成对抗网络生成基因调控元件生成模型，并根据先验序列优化其侧翼区域。通过遗传算法和DenseNet结构的预测模型对生成器生成的序列进行迭代优化，最终得到基于先验知识约束的条件式基因调控元件。本发明可用于高效快速的基因元件的设计；用于组成型或诱导型启动子的设计。经检测使用本发明的方法设计的组成型启动子具有高调控表达性能，所设计的诱导型启动子具有高诱导率，其调控性能超过已知天然与合成元件。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 局部 序列 约束 启动子 智能 设计 方法 装置 应用 | ||
【主权项】：
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